当您因工伤自己垫付了医药费后，可以按照以下步骤进行报销：

一、工伤认定

1. 单位申请：首先，您的单位应在事故发生后的30日内向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
2. 个人申请：如果单位未在规定时间内申请，您可以在事故发生后的1年内自行向社会保险行政部门提出工伤认定申请。

二、劳动能力鉴定（如需）

1. 鉴定条件：若您被认定为工伤且伤情稳定、有残疾或影响劳动能力时，需要进行劳动能力鉴定。
2. 鉴定流程：按照当地社会保险行政部门的指引，前往指定的医疗机构或鉴定中心进行劳动能力鉴定。

三、准备报销材料

在申请报销前，您需要准备以下材料：

1. 工伤认定决定书
2. 医院出具的诊断证明、病历、费用清单及发票等
3. 您的身份证明及与单位的劳动关系证明（如劳动合同）

四、申请报销

1. 单位代报：将准备好的报销材料交给单位，由单位向社保经办机构申请报销。如果单位已为您缴纳了工伤保险，相关费用将由工伤保险基金支付。
2. 个人申请：如果单位未为您缴纳工伤保险或拒绝为您申请报销，您可以携带相关材料直接向社保经办机构申请报销或协商支付。若协商不成，您可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

五、注意事项

1. 保留证据：请务必妥善保存所有与工伤及医疗费用相关的单据和证据，以便在申请报销或维权时使用。
2. 及时申请：请确保在规定的时限内提出工伤认定申请和报销申请，以免错过申请期限。
3. 了解政策：不同地区的工伤保险政策可能有所不同，请提前了解您所在地区的具体政策规定。

综上所述，工伤自己垫付的医药费报销流程包括工伤认定、劳动能力鉴定（如需）、准备报销材料、申请报销以及注意事项等步骤。请按照当地社会保险行政部门的指引和要求进行操作，以确保您的权益得到保障。