在退休时如果发现档案中缺少调令，这确实是一个需要关注的问题，因为调令是人事档案中的重要材料，对于证明个人工作经历、职位变动等方面具有重要作用。针对这种情况，您可以采取以下步骤来处理：

首先，您需要尽快联系您所在单位的人事部门或者档案管理部门，向他们说明情况，并询问是否可以提供相关的调令复印件或者证明文件。如果单位能够找到原始的调令或者相关记录，那么问题就相对容易解决。

如果单位无法提供调令或者相关证明，您可以尝试通过以下途径来补办或者查找：

1. 查询原始档案：

   • 如果您知道调令可能存放的地点或者机构，可以尝试直接联系该机构，查询是否有您的调令存档。
   • 您也可以前往当地的人力资源和社会保障局、人才交流中心等机构，咨询是否可以查询您的个人档案，并尝试找到调令的存档记录。

2. 线上查询档案：

   • 如您所在地提供了线上档案查询服务（如参考信息中提到的“厦门退休人员e家-档案预约平台”），您可以尝试通过线上平台预约查询档案，看是否能够找到调令的电子版或者相关信息。

3. 申请开具证明：

   • 如果无法找到原始的调令，您可以尝试向原单位或者相关机构申请开具一份证明文件，证明您的工作经历、职位变动等情况。这份证明文件虽然不能完全替代调令，但在一定程度上可以作为补充材料使用。

4. 咨询专业人士：

   • 如果您在处理过程中遇到困难或者不确定如何操作，可以咨询当地的人力资源和社会保障局、人才交流中心等机构的专业人士，他们可以提供更具体的指导和帮助。

最后，需要注意的是，由于调令是人事档案中的重要材料，补办或者查找过程可能会比较繁琐和耗时。因此，建议您在处理过程中保持耐心和积极的心态，同时与相关部门保持密切沟通，以便及时获取最新的进展和结果。