停止线等红灯时越过停止线，一般情况下不会扣分，但具体是否扣分还需根据实际情况判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 未通过路口的情况：

   • 如果车辆在红灯亮起时只是刚刚越过停止线，但立即停住了，且没有继续前行或倒车等违规行为，这种闯红灯行为通常不会被电子眼抓拍，因此不会受到处罚。此时，虽然车辆越过了停止线，但并未构成完整的闯红灯行为（即车辆未完全通过路口），所以一般不会扣分。

2. 交警指挥优先的情况：

   • 在交警现场指挥的情况下，应优先遵循交警的指示。即使信号灯为红灯，但如果交警示意可以通行，则车辆越过停止线不构成闯红灯行为，也不会扣分。

3. 可能被视为违规的情况：

   • 如果车辆越过停止线后，又进行了倒车或继续前行的动作，这可能会被视为闯红灯或妨碍交通安全的违法行为，从而面临罚款和扣分的处罚。
   • 在某些特定区域（如学校附近、医院门口等），可能有更严格的交通规则。在这些区域闯红灯，即使只是稍微越过停止线，也可能被视为严重违规，并受到相应的处罚。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十一条的规定，机动车在遇到停止信号时，应依次停在停止线以外。若红灯亮起时，车辆越过停止线但立即停住，并未继续行驶，这种情况通常不会被视为闯红灯而进行处罚。然而，具体是否扣分以及扣分多少，还需参照当地交通管理部门的规定。

综上所述，停止线等红灯时越过停止线是否会扣分，主要取决于车辆后续的行为以及当地的交通法规。为了避免不必要的扣分和罚款，建议驾驶人在行驶过程中严格遵守交通规则，密切关注交通信号灯的变化，并确保在红灯亮起时及时停车。如有任何关于交通法规的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。