红灯了越过斑马线车停下了，是否会扣分，取决于车辆的具体行驶情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 若车辆仅越线后及时停下：

   • 当红灯亮起时，如果车辆只是刚刚越过停止线，并且立即停在了斑马线上，没有继续前行，这种行为一般被认定为“越线停车”，而非严格意义上的闯红灯。
   • 根据相关法律法规，如《道路交通安全违法行为记分管理办法》，此类行为可能会受到一次记1分（也有说法是记2分，具体依据当地规定）的处罚，但通常不会按闯红灯处理。
   • 具体是否扣分以及扣分的多少，还会受到当地交通管理规定和执法标准差异的影响。

2. 若车辆继续行驶通过路口：

   • 如果车辆在红灯亮起后不仅停在了斑马线上，还继续行驶通过了对面路口，那么这种行为将被明确认定为闯红灯。
   • 按照《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，将受到罚款200元，并且驾驶证一次记6分的处罚。

3. 地区差异与执法标准：

   • 具体的判定和处罚措施可能会因地区和交警的执法标准而有所不同。因此，在处理此类交通违法事件时，应参考当地交通管理部门的具体规定。
   • 如果对交通违法处罚有异议，当事人有权通过申诉等途径向交警部门提供相关证据进行复核。

综上所述，红灯亮起时越过斑马线车停下，是否会扣分以及扣分的多少，取决于车辆的具体行驶情况和当地的交通管理规定。为避免不必要的交通违法和扣分，建议驾驶人在行驶过程中严格遵守交通信号灯指示，保持高度警惕。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。