针对您提出的“等红绿灯的时候越过了停止线，停在斑马线上是否扣分罚款”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、行为性质与一般情况下的处罚
当车辆在红灯亮起时，如果仅刚刚越过停止线并立即停在斑马线上，没有继续行驶，此行为通常被认定为越线停车，而非完整的闯红灯行为。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及相关规定，对于此类越线停车的行为，一般会被记2分，并可能面临200元左右的罚款。这是对此类违规行为的一般性处理标准。
二、特殊情况下的处罚可能加重
情节严重的情况：如果车辆在越线停车后，存在倒车进入停止线、停车后妨碍其他车辆和行人正常通行等更为严重的情节，那么处罚可能会更加严厉，有可能被扣6分。
交警部门的考量因素：交警部门在处理此类违规行为时，会综合考虑车辆的违规程度、对其他交通参与者的影响以及是否存在故意等因素，以确定具体的处罚措施。
三、地区差异与复核申诉
地区差异：不同地区对于越线停车行为的具体认定和记分标准可能存在一定差异。因此，在面对处罚时，您应参考当地交通管理部门的规定。
复核申诉权利：如果您对违章处罚结果不服，有权向交警部门进行复核申诉。在申诉过程中，如果您能提供行车记录影像等证据来证明当时存在特殊情况（如被大车遮挡视线等），交警部门在核实后可能会撤销处罚。
四、总结与建议
综上所述，等红绿灯时越过停止线并停在斑马线上，一般会按照越线停车进行处理，扣2分并处以罚款。但具体处罚结果还需根据当时的实际情况和交警部门的判断来确定。为了避免不必要的违规行为带来的法律后果，我建议您在行驶过程中严格遵守交通规则，注意观察交通信号灯和路况变化。同时，在面对处罚时，也应了解自己的合法权益和申诉途径。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。