针对您提出的“越线变红灯，停车等待，没有影响行人和车辆，是否会扣分”的问题，以下是我的详细解答：

1. 基本结论与情况分析：

   • 轻微越线且立即停住：如果您的车辆在红灯亮起时只是刚刚越过停止线，但立即停住了，且没有继续移动或影响其他车辆和行人通行，这种情况下通常不会被认定为闯红灯，因此一般不会被扣分。但根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，此类行为可能被视为“不按规定停车”，可能面临警告或者二十元以上二百元以下的罚款（具体金额由地方规定决定）。
   • 明显越线或移动：如果您的车身整体已经越过了停止线，并且之后还有明显的位置移动，或者车辆越过停止线后没有停下而是继续前行，这些行为都会被判定为闯红灯。闯红灯的处罚更为严厉，可能会被扣6分，并面临相应的罚款。

2. 法律依据与解析：

   • 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车行经交叉路口不按规定行车或者停车的，一次记1分（针对轻微越线且未造成交通影响的情况，但具体执法实践中可能因地区差异而有所不同）。
   • 判断是否闯红灯通常需要三张照片来佐证：车辆前轮过停止线、车辆后轮过停止线和车辆到达对面路口。如果只有前轮过线并及时停车，没有继续行驶至对面路口，则通常不会被认定为闯红灯。

3. 特殊情况下的处理建议：

   • 如果您是因为前方有大型车辆遮挡视线导致未能及时看到红灯而越线停车，或者是有交通警察现场指挥而按照交警的指示行驶导致的越线停车，您可以提供相关证据进行申诉，经核实后有可能撤销该处罚。
   • 即使不被认定为闯红灯或越线停车，您也可能因为“不按规定行驶”或“妨碍交通”等行为而受到警告、罚款等其他形式的处罚。因此，在行车过程中应始终保持注意力集中，严格遵守交通规则。

4. 后续行动建议：

   • 如果您不小心出现了类似情况，应及时向当地交警部门咨询相关政策和处理方式，以免产生不必要的麻烦和损失。
   • 了解并掌握当地的交通法规和处罚标准，以便在遇到问题时能够迅速做出正确的应对。

总结来说，越线变红灯后停车等待是否会扣分，取决于车辆越过停止线后的具体行为以及当地的交通法规和执法实践。为了确保行车安全并避免不必要的处罚，建议您在行车过程中始终保持注意力集中，严格遵守交通规则。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。