在公司收购农产品没有发票的情况下，入账处理需要遵循税法规定，并确保合法、合规。以下是根据您提供的信息和相关税法规定，为您整理的详细解答：

一、发票的重要性

发票是企业入账和税务处理的重要依据。根据《国务院关于修改<中华人民共和国发票管理办法>的决定》，所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项时，应当向收款方取得发票。因此，公司收购农产品时，应尽可能取得发票作为入账凭据。

二、不同收购对象的发票处理

1. 向农业生产者个人收购：

   • 企业可以向农业生产者个人（不包括个体经营者）收购自产农产品时自行开具农产品收购发票。但需满足真实收购业务、设置收购台账等条件，并严格按照当地税务机关的要求进行开具。
   • 税务处理上，企业可依据发票上的买价和规定的扣除率计算进项税额。

2. 向农业生产单位或农民专业合作社等收购：

   • 应要求对方开具免税的增值税普通发票。这些单位销售自产或本社成员生产的农产品免征增值税。
   • 取得发票后，企业同样可按规定的扣除率计算抵扣进项税额。

三、无法取得发票的处理方法

如果无法取得合规发票，公司应采取以下补救措施：

1. 补开发票：首先尝试联系销售方补开发票，并保留相关购买证据（如收购合同、付款凭证、农产品入库单等）以支持请求。

2. 税务机关代开：若销售方无法补开，公司可前往当地税务机关申请代开发票。需准备必要的证明材料（如收购合同、付款凭证、销售方身份证明等）并可能承担相应税费。

3. 税务影响：

   • 无法取得合规发票将导致进项税额无法抵扣，增加企业增值税税负。
   • 在企业所得税方面，无合法有效发票的采购成本不能税前扣除。除非能提供其他充分证明支出真实性、合理性的凭证，并经税务机关严格审核，否则将导致应纳税所得额增加，进而多缴纳企业所得税。

四、风险防范与建议

为了避免未来类似情况的发生，公司应加强内部管理，建立健全农产品收购管理制度，明确发票取得与管理的责任与流程。同时，应密切关注税法及相关政策的变动，及时调整税务处理策略以适应新规定。在遇到复杂或不确定的税务问题时，应及时咨询专业的税务机构或律师，以确保合规操作并降低税务风险。

综上所述，公司收购农产品时务必确保取得合法有效的发票。如无法取得发票，应采取积极措施补救，并加强内部管理以预防未来类似情况的发生。