结论：招标代理机构收取报名费是否违法不能一概而论，需分情况讨论。

1. 若招标文件或相关法规明确禁止收取报名费
   根据《招标投标法》及其实施条例，招标代理机构的行为需严格遵循招标文件约定及法定程序。若招标文件明确规定“不收取报名费”，或地方性法规、行业规范明确禁止此类收费（如部分省份出台的《招标投标管理办法》中规定“招标人或代理机构不得以报名费等名义变相收取费用”），则代理机构收取报名费属于违法行为，可能面临行政处罚（如警告、罚款），投标人也有权向行政监督部门投诉或通过法律途径主张返还费用。

2. 若招标文件允许收取且费用合理
   若招标文件明确约定可收取报名费，且费用金额合理（通常需与实际成本相符，如资料制作、系统维护等直接支出），且未违反《价格法》中关于“不得利用优势地位强制收费”的规定，则收取行为合法。但需注意：

   • 费用需公开透明，在招标文件中明确列明收费标准及用途；
     
   • 不得以报名费为门槛限制潜在投标人参与（如仅允许特定企业报名）；
     
   • 需提供正规发票或收据，否则可能涉嫌偷逃税款。

3. 若以报名费为名变相设置投标壁垒
   若代理机构通过高额报名费（如远超实际成本）或隐性收费（如“保证金”“资料费”等名义）排除竞争对手，可能违反《招标投标法》第18条“不得以不合理条件限制、排斥潜在投标人”的规定。此类行为不仅违法，还可能构成不正当竞争，需承担行政责任甚至民事赔偿。

建议：

• 对投标人：若遇违规收费，可要求代理机构出示收费依据（如招标文件条款、地方性法规），若无法提供或费用明显不合理，可向当地发改委、公共资源交易监管部门举报，或通过诉讼主张返还费用。
  
• 对招标代理机构：需严格审核收费依据，确保费用合法、合理且透明，避免因违规收费引发法律风险。
  

如有具体案例或地方性规定需进一步分析，可直接向我咨询。