针对您提出的“村民占用集体土地属于哪部门管”的问题，这确实是一个涉及多层次、多部门管理的综合性问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，要明确的是，农村集体土地的管理是一个复杂而细致的过程，它涉及多个部门和机构的共同努力与协作。具体来说，村民占用集体土地的管理主要涉及以下几个部门：

1. 自然资源主管部门：

   • 在国家层面，自然资源部负责全国土地资源的宏观管理和政策制定。
   • 在地方层面，县级及以上自然资源和规划局具体承担农村集体土地的管理工作，包括土地确权、土地流转、土地征收等。如果村民未经批准非法占用集体土地进行建设，自然资源主管部门将有权进行查处，并责令退还土地，根据土地利用总体规划的情况，采取限期拆除、没收建筑物、罚款等措施。

2. 农业农村主管部门：

   • 农业农村局在农村土地管理中占有重要地位，尤其聚焦于农民利益的保障。
   • 对于农村村民非法占地建住宅的情况，农业农村主管部门将负责查处，并责令退还土地，限期拆除新建房屋。同时，农业农村局还参与农村土地承包、土地流转等与农业生产直接相关的事务，确保土地使用权的确认、土地承包期的延续等工作的顺利进行。

3. 乡镇人民政府：

   • 乡镇人民政府具体负责本辖区内农村集体建设用地的日常管理工作。
   • 对于村民占用集体土地的行为，乡镇人民政府会进行初步审核、现场勘查，并协调解决使用过程中出现的矛盾和纠纷。几乎所有涉及农村集体土地的实际问题，如土地承包关系的调整、宅基地审批、土地使用情况的日常监督等，都需要乡镇政府来进行协调和解决。

4. 农村集体经济组织（通常为村民委员会）：

   • 作为土地的直接管理者，农村集体经济组织负责分配集体土地、制定土地使用规则，并对土地的收益进行分配。
   • 在村民占用集体土地的问题上，农村集体经济组织会起到基础性的管理和协调作用，确保土地使用的合法性和合规性。

实际建议：

• 如果您发现村民有非法占用集体土地的行为，首先可以向当地的乡镇人民政府反映情况，他们会对问题进行初步审核和现场勘查。
• 如果问题较为严重或涉及多个部门的管理权限，您可以进一步向县级及以上自然资源和规划局或农业农村局咨询或举报。
• 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据，如照片、视频、证人证言等，以便在需要时提供给相关部门进行调查和处理。

综上所述，村民占用集体土地的管理是一个涉及多部门、多层次的综合性问题。通过明确各部门的职责和分工，形成上下联动、左右协调的管理机制，才能确保土地资源的合理利用和土地市场的正常秩序。希望以上解答能对您有所帮助。