起诉小三是否会留案底，关键在于案件的性质和最终判决结果。以下是具体分析：

1. 民事案件情况：

   • 当起诉小三的案件属于民事纠纷时，比如原配起诉小三要求返还财产等，这类案件主要处理的是私人间的权益争议，不涉及犯罪行为。因此，即使小三在民事诉讼中败诉，也不会留下案底。民事案件的处理结果主要是对当事人之间的民事权利义务进行判定和调整，不会产生犯罪记录。

2. 刑事案件情况：

   • 如果小三的行为构成刑事犯罪，例如重婚罪（明知他人有配偶而与之结婚或以夫妻名义同居生活），并且被公安机关立案、检察院提起公诉、法院最终判决有罪，那么就会留下案底。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，重婚罪可处二年以下有期徒刑或者拘役。此外，如果在诉讼过程中小三存在其他犯罪行为（如诈骗、伪造证据等），并被法院认定构成犯罪，同样会留下案底。

3. 特殊情况说明：

   • 在民事诉讼过程中，如果小三实施了与诉讼相关的犯罪行为，如伪造证据、妨碍司法公正等，并且这些行为被法院认定构成犯罪，那么小三也会因此留下案底。这强调了无论案件性质如何，只要涉及犯罪行为并受到刑事处罚，都会留下犯罪记录。

建议与指导：

• 对于面临被起诉的小三而言，应尽快了解自身的法律责任和可能的法律后果，以便做出适当的应对。如果对法律程序或可能面临的法律责任有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
• 对于原配而言，在决定起诉小三之前，也应确保诉讼的合法性和有效性，并了解可能的法律结果。这有助于避免不必要的法律风险和损失。如果你有这方面的疑问或需要进一步的法律指导，也可以直接向我提问。

综上所述，起诉小三是否会留案底取决于案件的具体性质和最终判决结果。在处理此类法律问题时，务必根据具体情况进行细致分析，并寻求专业的法律帮助以确保自身权益得到妥善保护。