结论：告“小三”破坏家庭，“小三”是否会留案底，关键在于案件的性质和最终判决结果。如果是民事纠纷，通常不会留下案底；但如果涉及刑事犯罪并被判定有罪，则会留下犯罪记录。
详细分析：
民事案件情况：
- 当“小三”被起诉的案件属于民事纠纷，例如原配起诉“小三”要求返还财产等，这类案件主要涉及私人间的权益争议，并不涉及犯罪行为。因此，即使“小三”败诉，也不会留下案底。民事案件的处理主要是对当事人之间的民事权利义务进行判定和调整，不会产生犯罪记录。
刑事案件情况：
- 如果“小三”的行为构成刑事犯罪，例如重婚罪（明知他人有配偶而与之结婚或以夫妻名义同居生活），并且被公安机关立案、检察院提起公诉、法院最终判决有罪，那么就会留下案底。根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条的规定，重婚罪可处二年以下有期徒刑或者拘役。
- 另外，如果“小三”明知是现役军人的配偶而与之同居或者结婚，还可能构成破坏军婚罪，根据《中华人民共和国刑法》第二百五十九条的规定，可处三年以下有期徒刑或者拘役。
- 除了上述两种特定的刑事犯罪外，如果“小三”在诉讼过程中实施了其他犯罪行为，如诈骗、伪造证据等，并被法院认定构成犯罪，同样会留下案底。
特殊情况与建议：
- 在处理涉及“小三”破坏家庭的问题时，如果案件涉及刑事犯罪，建议受害者及时收集证据并报警，以便公安机关能够立案侦查。同时，也可以考虑向法院提起刑事自诉，要求追究“小三”的刑事责任。
- 对于“小三”而言，如果面临被起诉的情况，应尽快了解自身的法律责任和可能的法律后果，以便做出适当的应对。如果确实存在违法行为，应积极配合调查并承担相应的法律责任。
- 无论案件性质如何，都建议双方通过合法途径解决问题，避免采取过激行为或陷入不必要的法律纠纷。
总结：
“小三”被起诉后是否会留案底，取决于案件的具体性质和最终判决结果。在民事案件中通常不会留下案底，但在刑事案件或涉及犯罪行为的情况下则可能会留下犯罪记录。因此，在处理相关法律问题时，务必根据实际情况咨询我，以获取准确的法律意见和指导。