面包车超员2人的处理及扣分情况，主要依据车辆的性质（营运或非营运）以及超员的比例来确定。以下是对这一问题的详细解答：

一、非营运性质面包车超员2人的处理

1. 超员比例计算：

   • 若面包车核载7人，实载9人，超员比例约为28.6%。
   • 若面包车核载9人，实载11人，超员比例约为22.2%。

2. 处罚措施：

   • 记分：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶此类车辆超员未达20%的，记1分；超员20%以上未达50%的，记3分。在您提到的超员2人的情况下，通常属于超员20%以上未达50%的范围，因此会记3分。
   • 罚款：根据《道路交通安全法》第九十条，处警告或二十元以上二百元以下罚款。

二、营运性质面包车超员2人的处理

1. 超员比例计算（同样以核载7人或9人为例，实载增加2人）：

   • 超员比例会超过20%。

2. 处罚措施：

   • 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶营运客车（不含公共汽车）载人超员20%以上的，记6分。
   • 罚款：根据《道路交通安全法》第九十二条，处五百元以上二千元以下罚款。

三、其他相关规定及注意事项

1. 货运机动车超载：

   • 如果面包车用于货运并超载，也将面临罚款。超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或违规载客的，处五百元以上二千元以下罚款。

2. 严重超载或屡教不改：

   • 公安机关交通管理部门可扣留机动车至违法状态消除。
   • 对于运输单位车辆，经处罚不改的，对直接负责的主管人员还可处二千元以上五千元以下罚款。

3. 行车安全：

   • 面包车超员不仅违反法律法规，更严重影响行车安全，增加交通事故风险。因此，驾驶者应严格遵守交通法规，按照车辆核定人数载客。

四、总结与建议

面包车超员2人的处罚因车辆性质和超员比例而异。非营运面包车通常记3分并罚款，而营运面包车则可能记6分并面临更高的罚款。无论何种情况，超员都是严重的交通违法行为，不仅危及行车安全，还可能引发严重的法律后果。因此，我强烈建议驾驶员务必遵守交通法规，合理规划行程和乘客数量，确保行车安全。同时，交通管理部门也应加强监管，对超员行为进行严厉打击，以维护道路交通秩序和安全。