企业对供应商罚款是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 合同有明确约定且不违反法律强制性规定时，可能合法
   若企业与供应商在合同中明确约定了“违约罚款条款”（如逾期交货、质量不达标等情形下的违约金或赔偿金），且该条款不违反《民法典》中关于违约金过高调整（第585条）、公平原则（第6条）等强制性规定，则企业依据合同主张“罚款”可能被认定为合法。
   关键点：合同需双方自愿签署、条款内容明确具体，且罚款金额需与实际损失相当（过高部分可能被法院调减）。

2. 无合同约定或约定违法时，通常不合法
   若双方未在合同中约定罚款条款，或企业单方面制定“罚款规则”（如供应商手册、内部规定等）并强制执行，则可能因缺乏法律依据被认定为违法。此外，若罚款条款存在“显失公平”（如罚款金额远超实际损失）、“排除对方权利”等情形，也可能被认定无效。
   典型案例：企业以“供应商未参加培训”为由罚款，但合同中无相关约定，此类罚款通常不被支持。

3. 行政处罚与民事赔偿的区分
   需注意：企业无权行使行政处罚权（如“罚款”是行政机关的专属权力），但可依据《民法典》主张“违约赔偿”。若企业以“罚款”名义扣款，但实际性质为赔偿损失，需证明损失与违约行为的因果关系及金额合理性；若无法证明，可能被认定为非法扣款。

建议：

• 对企业：若需约束供应商行为，应在合同中明确违约责任条款（如违约金、赔偿计算方式），避免使用“罚款”等易引发争议的表述；
  
• 对供应商：签订合同前仔细审查违约条款，若遭遇非法罚款，可依据《民法典》主张返还并要求赔偿损失。
  

如有具体合同条款或案例细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。