结论：工厂旷工三天自动离职后，劳动者对于已经实际工作的天数通常有权获得相应的工资，但具体情况需根据法律法规、公司规章制度以及是否给公司造成损失来综合判断。
详细分析：
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及劳动部《工资支付暂行规定》，劳动者提供了正常劳动，即有权利获得相应的劳动报酬。这意味着，即使劳动者因旷工三天按单位规定被视为自动离职，其在正常出勤工作期间所付出的劳动，用人单位仍有义务支付相应的工资。
公司规章制度的影响：
- 如果公司的规章制度中明确规定了连续旷工三天即视为自动离职，并且该规章制度已经过合法的制定和公示流程，那么在这种情况下，员工旷工三天可能会被认定为自动离职。然而，这并不意味着用人单位可以拒绝支付劳动者已经实际工作期间的工资。除非规章制度中明确规定了旷工期间的工资扣除规则，且该规则不违反法律法规的强制性规定（如扣除工资后不低于最低工资标准）。
经济损失赔偿与工资扣除：
- 如果劳动者的旷工行为给用人单位造成了实际经济损失，用人单位有权要求劳动者赔偿。但赔偿的扣除需遵循法律规定，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这意味着，即使劳动者需要赔偿损失，用人单位也不能完全拒绝支付其应得的工资。
特殊情况处理：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定旷工三天即自动离职且不给工资，且该规定已经过民主程序制定并向劳动者公示，同时不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以依据此规定执行。但这种情况较为特殊，且需要严格满足上述条件。
建议与行动步骤：
劳动者：
- 在离职前，尽量按照公司规定和劳动合同约定办理离职手续，以减少不必要的纠纷。
- 了解自己的合法权益，包括工资支付、经济补偿等，并在遇到问题时及时寻求法律援助或向我咨询。
- 如果用人单位拒绝支付工资或存在其他违法行为，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
用人单位：
- 在处理旷工离职员工的工资问题时，应遵守相关法律法规和公司规章制度，确保处理的合法性和合理性。
- 建立健全的考勤制度和工资支付制度，明确旷工的处罚措施和工资扣除规则，以避免因管理不善而引发的劳动纠纷。
- 在制定和执行相关规章制度时，应确保符合法律法规的要求，并充分保障劳动者的合法权益。
总结：旷工三天自动离职后是否有工资，关键在于用人单位的规章制度、劳动合同的具体内容以及劳动者的实际工作表现。在任何情况下，用人单位都不能违反法律法规的强制性规定，拒绝支付劳动者应得的工资。同时，劳动者在面临工资纠纷时，应依法维权，通过合法途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。