结论：平时请假用周六加班顶是否合理，这主要取决于公司的规章制度、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：
一、公司规章制度与劳动合同约定
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定了员工请假可以用加班时间进行抵扣，并且这种规定不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法是合理的。
- 反之，如果公司规章制度中没有相关规定，或者规定不允许用加班时间抵扣请假，那么员工擅自用周六加班顶请假可能就不符合公司规定。
劳动合同约定：
- 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要文件。如果劳动合同中明确约定了员工请假可以用加班时间进行抵扣，那么这种做法是合法的，也是合理的。
- 如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，那么就需要参考公司规章制度以及相关法律法规的规定。
二、相关法律法规的规定
加班与调休：
- 根据《劳动法》及相关规定，员工加班后，公司应当给予相应的加班费或者安排调休。如果公司选择安排调休，那么调休的时间应当与加班的时间相对应。
- 在这个背景下，如果员工请假，并且公司同意用其周六的加班时间进行抵扣，这实际上可以视为一种调休的安排。但是，这种安排需要双方协商一致，并且不能违反法律法规的强制性规定。
请假制度：
- 请假制度是公司内部管理的重要制度之一。员工请假需要按照公司规定的流程进行申请和审批。如果员工擅自用加班时间抵扣请假，而没有经过公司的审批，那么这种做法可能就不符合公司的请假制度。
三、实际操作中的建议
与公司沟通：
- 如果员工有请假的需求，并且希望用周六的加班时间进行抵扣，建议先与公司的人力资源部门或者上级领导进行沟通，了解公司的相关规定和流程。
- 在沟通的过程中，员工可以明确表达自己的需求，并且询问公司是否同意这种安排。如果公司同意，那么双方可以签订相关的协议或者确认书，以明确双方的权利义务。
保留证据：
- 如果员工与公司就请假用加班时间抵扣的问题达成了协议，建议员工保留好相关的证据，如聊天记录、邮件、确认书等。这些证据可以在后续发生纠纷时作为证明双方约定的重要依据。
遵守法律法规：
- 无论公司是否同意员工用加班时间抵扣请假，员工都需要遵守相关的法律法规。如果公司的做法违反了法律法规的强制性规定，员工有权向相关部门进行投诉或者举报。
总结与进一步思考：平时请假用周六加班顶是否合理，并没有一个绝对的答案。它取决于公司的规章制度、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。因此，建议员工在遇到这种情况时，先与公司进行沟通，了解公司的相关规定和流程，并且遵守相关的法律法规。如果还有其他疑问或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。