在法人跟实际经营者不一致的情况下，起诉谁需根据具体情形和法律关系来确定。以下从不同角度进行分析：
合同纠纷角度：
- 如果纠纷是基于合同产生的，且合同是法人名义签订的，那么原则上应以法人为被告。因为合同具有相对性，合同的权利义务通常由签订合同的主体承担。
- 但若实际经营者以法人名义签订合同，且合同相对方有理由相信实际经营者有代理权（如表见代理情形），或者法人对实际经营者的行为进行了追认，那么法人仍需承担责任。同时，如果实际经营者的行为构成欺诈或恶意串通，损害法人利益，法人可在承担责任后向实际经营者追偿。
- 特殊情况：如果实际经营者与合同相对方恶意串通，损害法人利益，法人不仅可以向合同相对方主张权利，还可以根据具体情况向实际经营者追究责任。
侵权责任角度：
- 如果实际经营者的行为构成侵权，如侵犯他人财产权、人身权等，那么被侵权人有权选择起诉法人或实际经营者，或者同时起诉两者。这取决于侵权行为的具体情形、法人对侵权行为的过错程度以及实际经营者的独立责任能力。
- 举例：若实际经营者因管理不善导致法人财产损失，同时该损失也侵害了第三方的利益，第三方可以选择起诉法人或实际经营者，或者两者都诉。法人承担责任后，若能证明实际经营者存在过错，可向其追偿。
公司法角度（针对公司法人）：
- 如果法人是公司，且实际经营者是公司的董事、高级管理人员或控股股东等，其利用关联关系损害公司利益，那么公司有权起诉这些实际经营者，要求其承担赔偿责任。
- 法律依据：根据《公司法》的相关规定，公司的董事、监事、高级管理人员应当遵守法律、行政法规和公司章程，对公司负有忠实义务和勤勉义务。若违反这些义务，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。
刑事责任角度：
- 如果实际经营者的行为构成犯罪，如职务侵占罪、挪用资金罪等，那么司法机关将依法追究其刑事责任。在此情况下，法人可能作为受害单位出现，但起诉权在检察机关，法人可以配合调查并提供证据。
- 特殊情况：若法人本身也涉及犯罪行为，如单位犯罪，那么法人及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员都将被追究刑事责任。
建议：
- 在处理此类纠纷时，首先应明确纠纷的性质和法律关系，确定是合同纠纷、侵权责任纠纷还是其他类型的纠纷。
- 收集并整理相关证据，如合同、交易记录、侵权行为证明等，以支持自己的主张。
- 根据具体情况选择合适的被告，并考虑是否需要同时起诉多个主体。
- 如有必要，可咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
总结：法人跟实际经营者不一致时起诉谁，需根据纠纷性质、法律关系以及具体证据来确定。在处理此类纠纷时，应谨慎分析、全面考虑，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善维护。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。