辞职后工资应在办理离职手续时一次性结清，这是基本原则。以下从不同角度详细阐述：

1. 法律规定角度
   根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资。若用人单位拖欠工资，劳动者可向当地劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁主张权益，要求支付工资及可能的经济补偿金（如因拖欠工资被迫离职的情形）。

2. 特殊情况处理

   • 未结清工资的合法性：若双方约定分期支付（如涉及绩效提成、项目奖金等需后期核算的情形），需以劳动者书面同意为前提，且支付周期不得违反地方性法规（如部分地区规定离职后最长30日内结清）。
     
   • 扣减工资的边界：用人单位仅可扣减劳动者欠付的款项（如借款、赔偿损失等），且扣减金额不得超过当月工资的20%，剩余部分不得低于当地最低工资标准。若用人单位无正当理由扣减工资，劳动者可要求全额支付并主张赔偿。

3. 实务操作建议

   • 离职前确认：劳动者应在离职前与用人单位核对工资明细（包括基本工资、加班费、奖金等），并要求出具书面结清证明。
     
   • 保留证据：保存劳动合同、工资条、考勤记录、离职协议等材料，以备维权时使用。
     
   • 协商与投诉：若发生纠纷，优先通过协商解决；协商不成时，可向劳动监察部门投诉（时效2年）或申请劳动仲裁（时效1年）。

提示：若涉及复杂情形（如竞业限制补偿、股权激励等），建议提供具体细节进一步分析。