工程协调费本身并不违法，但其合法性取决于具体情境和支付方式。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合法情形：

   • 正常业务往来：在建设工程中，如果工程协调费是作为正常业务往来的一部分，用于支付协调各方关系、解决工程中出现的非技术性问题等合理费用，且该费用在合同中有明确约定，支付方式合法合规，那么这种工程协调费是合法的。例如，在大型工程项目中，由于涉及多个施工单位、供应商和政府部门，需要专门的协调人员来确保工程顺利进行，此时支付的协调费就是合理的。
   • 符合行业惯例：在某些行业或地区，工程协调费可能被视为一种行业惯例或潜规则，只要这种费用不违反法律法规的强制性规定，且双方自愿达成协议，那么这种费用也是合法的。但需要注意的是，行业惯例不能成为违法的借口，如果行业惯例本身违反了法律法规，那么这种惯例是不被认可的。

2. 违法情形：

   • 行贿受贿：如果工程协调费被用作行贿受贿的工具，即一方为了获取不正当利益而向另一方支付协调费，或者另一方利用职务之便索取协调费，那么这种行为就构成了行贿受贿，是违法的。例如，施工单位为了获得工程承包权而向建设单位负责人支付协调费，或者建设单位负责人利用职务之便向施工单位索取协调费，都属于行贿受贿行为。
   • 违反法律法规：如果工程协调费的支付方式或金额违反了相关法律法规的强制性规定，如超过了法定限额、未按照规定程序支付等，那么这种费用也是违法的。例如，根据相关法律法规的规定，某些类型的工程协调费可能受到限制或禁止，如果违反了这些规定，就会面临法律风险。

法律建议：

• 明确合同条款：在签订建设工程合同时，应明确约定工程协调费的支付方式、金额和用途等条款，以避免后续产生纠纷。
• 遵守法律法规：在支付和收取工程协调费时，应严格遵守相关法律法规的强制性规定，确保费用的合法性和合规性。
• 保留相关证据：为了证明工程协调费的合法性和合规性，应保留好相关证据，如合同、支付凭证、发票等。

可能后果：

• 如果工程协调费被认定为违法，支付方和收取方都可能面临法律责任，包括罚款、没收违法所得、甚至刑事责任等。
• 违法支付和收取工程协调费还可能损害企业的声誉和信誉，影响企业的长期发展。

因此，在处理工程协调费问题时，应谨慎对待，确保费用的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。