针对您提出的“公司违法克扣工资怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

公司违法克扣工资，将面临一系列严重的法律后果，这些后果涵盖了民事责任、行政责任，甚至在某些极端情况下，还可能涉及刑事责任。

一、民事责任

1. 限期支付与加付赔偿金：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，如果公司未按时足额支付员工劳动报酬，劳动行政部门会责令其限期支付。若公司逾期不支付，将需要按应付金额的百分之五十至百分之一百的标准向员工加付赔偿金。例如，若公司克扣了员工5000元工资，逾期未支付，则可能需额外支付2500元至5000元的赔偿金。

2. 劳动者解除合同及经济补偿：

   • 如果公司未及时足额支付工资，员工有权解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。经济补偿的金额根据员工在公司工作的年限来计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。

二、行政责任

• 公司若克扣或无故拖欠员工工资，劳动行政部门会进行监督检查，并责令改正。根据《劳动保障监察条例》，公司除需限期支付员工工资外，逾期不支付还需按应付金额的50%以上1倍以下的标准计算，向员工加付赔偿金。劳动行政部门有权通过下达限期整改指令书等方式，要求公司及时补发克扣的工资。

三、刑事责任

• 在特定情形下，克扣工资行为可能构成犯罪。根据《刑法》的相关规定，如果公司以转移财产、逃匿等方法逃避支付员工劳动报酬，或有能力支付而不支付，数额较大，且经政府有关部门责令支付仍不支付的，将构成拒不支付劳动报酬罪。公司可能面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金的刑事处罚。如果单位犯此罪，还将对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法处罚。

四、具体法律责任与维权途径

1. 民事赔偿与经济补偿：

   • 除全额支付克扣的工资外，公司可能还需支付相当于工资报酬一定比例的经济补偿金。
   • 若因克扣工资造成员工其他损失，如工伤、医疗待遇损失等，公司也需按相应规定进行赔偿。

2. 行政处罚：

   • 劳动行政部门可责令公司支付员工工资报酬、经济补偿，并可责令支付赔偿金。具体标准依据造成的损失而定，逾期不支付的单位还将被处以罚款，对直接责任人也有相应的罚款规定。

3. 维权途径：

   • 员工可以向当地人力资源社会保障部门投诉举报，提交书面材料以维护自己的权益。
   • 员工也可以申请劳动仲裁，仲裁时效为知道权益受损之日起一年内，可主张工资差额、赔偿金等诉求。
   • 如果对仲裁结果不服，员工还可以在15日内向法院起诉，法院将依法强制执行生效判决。

五、典型案例参考

• 例如，某科技公司克扣绩效工资案，人社局查实后责令补发工资12万元，加付赔偿金6万元，并对公司处以2万元罚款，法定代表人被罚5000元。这一案例充分展示了公司违法克扣工资将面临的严重法律后果。

综上所述，公司应严格遵守相关法律法规，确保按时足额支付员工工资，以避免可能的民事、行政及刑事责任。员工在遇到公司违法克扣工资的情况时，应积极维护自己的权益，通过投诉举报、劳动仲裁或司法救济等途径来寻求帮助。