关于摩托车侧箱是否合法的问题，这主要取决于侧箱的安装是否改变了摩托车的原有结构、构造或特征，并且是否符合相关法律法规的规定。

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，任何单位或者个人都不得拼装机动车或者擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征。这意味着，如果摩托车的侧箱安装导致了车辆结构的改变，比如增加了额外的支撑结构、改变了车身线条等，那么这种安装就可能是违法的。

其次，我们来看具体的法规执行情况。以贵州省公安厅发布的信息为例，摩托车加装尾箱（这里可以类比为侧箱的一种形式，尽管位置不同，但性质相似）是被视为交通违法行为的。这是因为加装尾箱改变了摩托车的原有构造，且不在可以备案的范围之内。虽然这一规定是针对尾箱的，但我们可以合理推断，对于侧箱的安装，如果同样改变了摩托车的结构或构造，也会面临相同的法律问题。

那么，如何判断摩托车侧箱的安装是否合法呢？一个基本的原则是，侧箱的安装不应该改变摩托车的原有结构、构造或特征，且不应该影响车辆的安全性能。如果侧箱的安装只是简单地附加在摩托车上，没有改变车辆的结构或构造，且经过专业评估确认不会影响车辆的安全性能，那么这种安装可能是合法的。但是，在实际操作中，由于不同地区的法规执行力度和具体规定可能存在差异，因此最好在安装前咨询当地的车管所或交通管理部门，以确认侧箱的安装是否合法。

此外，即使侧箱的安装在技术上是可行的，且符合当地法规的要求，车主也需要注意侧箱的使用安全。比如，侧箱的固定应该牢固可靠，避免在行驶过程中脱落或晃动；侧箱内不应该放置过重或易滚动的物品，以免影响车辆的平衡和稳定性。

综上所述，摩托车侧箱的合法性取决于多个因素，包括侧箱的安装方式、是否改变车辆结构或构造、是否符合当地法规的要求等。因此，在安装侧箱前，车主最好咨询当地的车管所或交通管理部门，以确认安装的合法性，并确保侧箱的使用安全。