结论前置：公司并非在所有情况下都有权利扣除员工工资，其扣薪行为必须严格遵循法律法规，并基于合法、合理的事由。以下是对此问题的详细分析：
一、公司有权扣除工资的法定情形
代扣代缴个人所得税：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，公司有义务代扣代缴员工的个人所得税。这是公司的法定义务，员工也有义务配合完成税务申报和缴纳。
代扣代缴社会保险费用：
- 包括养老保险、医疗保险、失业保险等，公司需按照法律规定为员工缴纳社会保险费用，并从员工工资中代扣个人应负担的部分。
法院判决或裁定要求代扣的抚养费、赡养费等：
- 在特定法律程序中，如离婚诉讼、赡养纠纷等，法院可能判决或裁定要求公司代扣员工的抚养费、赡养费等，公司需依法履行代扣义务。
因劳动者原因给用人单位造成经济损失的赔偿：
- 若员工因故意或重大过失给公司造成损失，公司可依法要求赔偿。根据《工资支付暂行规定》第十六条，经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
违反公司规章制度或劳动合同的违约金（如服务期约定、竞业限制）：
- 若劳动合同或公司规章制度中明确约定了服务期违约金、竞业限制违约金等，且员工违反了相关约定，公司有权要求员工支付违约金，并可从工资中扣除（但需注意扣除比例和最低工资标准）。
事假期间未提供劳动的无薪处理：
- 员工请事假期间，公司可不支付工资。这是基于员工未提供劳动的事实，公司无需支付相应报酬。
绩效挂钩的工资调整：
- 若劳动合同明确约定绩效工资与考核结果挂钩，公司可根据考核结果进行相应扣减。但需确保考核制度的合法性和合理性，避免滥用考核权损害员工权益。
二、公司无权扣除工资的情形
迟到、早退罚款：
- 除非劳动合同或规章制度有明确约定且程序合法，否则公司不得以迟到、早退为由直接罚款。公司可以通过其他方式（如警告、扣减绩效分等）进行管理，但不得直接扣减工资。
旷工一天罚三天工资：
- 此类惩罚性扣款通常缺乏法律依据。旷工期间的工资可按无薪处理，但额外罚款无效。公司应依据实际旷工天数扣减相应工资，而非进行惩罚性扣款。
强制乐捐等变相罚款：
- 未经员工同意的强制性捐款或罚款均属违法行为。公司不得以任何形式强制员工捐款或罚款，否则将面临法律责任。
未完成工作任务的全额扣薪：
- 除非劳动合同明确约定任务完成与工资全额挂钩，否则公司不得以此为由全额扣发工资。公司应依据实际完成情况合理扣减工资，而非进行全额扣发。
怀孕女职工产检时间扣薪：
- 女职工产检时间视为正常出勤，公司应支付工资。公司不得以产检为由扣减女职工工资或进行其他形式的处罚。
以实物代替货币工资：
- 工资应以货币形式支付，不得以实物折抵。公司应按时足额支付员工货币工资，不得以任何理由用实物替代。
员工辞职扣工资：
- 员工依法辞职时，公司不得无故扣押工资。公司应在员工办理离职手续后按时支付剩余工资，不得进行无故扣减。
三、公司违法扣薪的法律后果
- 行政责任：劳动行政部门可责令限期支付差额，逾期加付赔偿金（应付金额50%-100%）。
- 民事责任：员工可通过劳动仲裁或诉讼主张补发工资及经济补偿金。
- 刑事责任：恶意欠薪数额较大或持续时间较长的，可能被追究刑事责任。
四、建议与行动
- 了解公司规章制度：员工应仔细阅读并了解公司的规章制度和劳动合同条款，特别是关于工资扣除的部分。
- 保留证据：若公司存在违法扣薪行为，员工应保留相关证据（如工资条、扣款通知等）以便维权。
- 及时沟通：若对公司扣薪行为有异议，员工应及时与公司沟通协商解决。
- 寻求法律援助：若协商无果或公司拒绝改正违法行为，员工可向当地劳动监察部门投诉举报或申请劳动仲裁、提起诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
总之，公司在扣除员工工资时必须严格遵守法律法规和合同约定，确保扣除的合法性、合理性和透明度。员工也应了解自身权益并积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。