结论：合同中约定“本合同自双方签署之日起生效”，仅盖章而未签字，合同是否生效需结合具体情形判断。若合同未明确约定“签字且盖章”为生效条件，仅盖章通常可视为合同生效；若明确约定需“签字且盖章”，则仅盖章可能导致合同未生效。

具体分析如下：

1. 合同生效条款的约定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第五百零二条，依法成立的合同自成立时生效，但法律另有规定或当事人另有约定的除外。若合同中明确约定“本合同自双方签署之日起生效”，这里的“签署”通常理解为包括签字和盖章两种形式，但具体需结合合同文本及双方交易习惯判断。
   • 若合同未明确约定“签字且盖章”为生效条件，仅约定“签署”或类似表述，且双方在实际操作中仅进行了盖章而未签字，从交易效率和诚实信用原则出发，通常可认为合同已经生效。

2. 签字与盖章的法律要求：

   • 签字：自然人需本人签署或使用符合法律规定的电子签名；法人或组织需由法定代表人或其授权代表签字。
   • 盖章：公章具有最高对外效力，通常视为法人意思表示；合同专用章效力等同于公章；部门章或财务章一般不具备签约效力，除非有特别授权。
   • 若合同明确约定“签字且盖章”为生效条件，则二者缺一不可。仅完成一项（如仅盖章）可能导致合同未生效。

3. 实务中的常见问题及解决方案：

   • 仅有盖章是否有效：若合同约定“签字且盖章”，仅盖章可能使合同未生效。此时，建议双方补充签字程序并书面确认追认，以确保合同生效。
   • 扫描件或传真件的效力：一般视为复印件，不具备直接效力。可通过事后补签原件或结合履约事实主张合同成立。
   • 电子合同的特殊规则：若合同为电子形式，需满足《电子签名法》规定的可靠电子签名条件，如身份认证、时间戳等。

4. 风险防范建议：

   • 合同条款优化：明确生效条件，如“本合同自双方法定代表人或授权代表签字并加盖公章后生效”。
   • 签约流程管理：使用骑缝章防止换页篡改，要求对方提供营业执照、授权委托书等资质文件留存备查。
   • 证据固化措施：签订过程录像或公证，通过EMS寄送合同并要求签收回执。

示例说明：

• 假设甲乙双方签订一份买卖合同，合同中约定“本合同自双方签署之日起生效”。若双方在实际操作中仅进行了盖章而未签字，但合同文本未明确约定“签字且盖章”为生效条件，且双方交易习惯中盖章即视为生效，则合同可认为已经生效。
• 若合同中明确约定“本合同自双方法定代表人或授权代表签字并加盖公章后生效”，而双方仅进行了盖章而未签字，则合同可能未生效。此时，双方需补充签字程序并书面确认追认，以确保合同生效。

后续行动建议：

• 若您对合同生效条款存在疑问或担忧，建议仔细审查合同文本，明确生效条件的具体约定。
• 若合同已经签订但生效条件存在争议，建议及时与对方沟通协商，必要时可寻求法律救济途径解决争议。

如有其他法律问题，可直接向我咨询。