合同约定“签字之日生效”但只盖了章，合同是否有效需分情况讨论：
合同通常情形下的有效性
- 法律依据与合同生效条件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，但法律另有规定或当事人另有约定的除外。合同成立通常要求当事人均签名、盖章或者按指印。若合同中明确约定“签字之日生效”，这属于当事人对合同生效条件的特别约定。然而，在实务操作中，若仅盖章而未签字，但合同内容合法、不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，且当事人具备相应的民事行为能力，意思表示真实，同时合同已实际履行（如一方已履行主要义务，对方接受），那么该合同仍可能被认定为有效。这是因为实际履行行为可以视为对合同生效条件的补正或变更，体现了双方当事人的真实意愿。
- 举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，合同中约定“签字之日生效”。在签订时，甲方仅盖了章而未签字，但乙方已按照合同约定交付了货物，甲方也接受了货物并支付了款项。在此情况下，尽管甲方未签字，但合同已因实际履行而生效。
合同效力存在瑕疵的情况
- 违反法律强制性规定：若合同内容本身违反了法律、行政法规的强制性规定，如涉及非法交易或侵犯他人合法权益，即使双方盖章（无论是否签字），合同也无效。例如，买卖毒品的合同，无论是否签字盖章，均不具有法律效力。
- 恶意串通损害他人利益：若合同双方当事人恶意串通，通过签订合同来损害国家、集体或第三人的利益，即使合同按照约定盖章（无论是否签字），也会被认定为无效。例如，债务人为了逃避债务，与他人恶意串通签订虚假的买卖合同，低价转让财产。
- 主体不适格：若当事人不具备相应的民事行为能力，如无民事行为能力人签订的合同，即使完成盖章（无论是否签字），合同也无效。根据法律规定，不满八周岁的未成年人、不能辨认自己行为的成年人是无民事行为能力人，其民事法律行为应由法定代理人代理实施。
- 盖章的真实性：如果盖章是伪造的，或者由于其他原因导致无法确认其真实性，合同可能因此而被认定为无效或部分无效。在签署合同时，应确保盖章的真实性和有效性，以避免后续的法律纠纷。
特殊情况的考虑
- 法律特别规定：如果法律对合同的生效有特别的规定，即使合同上写了“签字之日生效”，也可能需要满足这些特别规定后才能生效。例如，某些合同可能需要办理批准、登记等手续后才能生效。
- 其他生效条件或期限：合同中可能存在除签字盖章外的其他生效条件或期限，这些条件和期限也必须得到满足，合同才能生效。例如，合同可能约定“自双方签字盖章且满足某条件后生效”或“自签字盖章之日起X日内生效”等。
总结与建议：
- 合同约定“签字之日生效”但只盖了章，合同是否有效需结合合同内容、相关法律法规及实际情况进行综合判断。
- 在签署合同时，应确保签字和盖章的真实性和有效性，并仔细阅读合同条款，了解合同的生效条件和期限。
- 如对合同的效力问题存在疑问或担忧，建议及时向我咨询，以便获取更准确的法律意见和帮助。