对于二十多年的民事案件是否可提出执行异议及如何处理的问题，结论前置如下：
一般情况下，二十多年的民事案件若已过执行时效，则难以直接提出执行异议以启动或恢复执行程序。但需注意，若存在特殊情形，如当事人双方达成还款协议等，可能构成对原债务的重新确认，从而影响执行时效的计算。
若案件存在特殊情形，如发现新的财产线索或原执行程序存在违法违规行为，仍可尝试提出执行异议或申请恢复执行。但需提供充分证据支持，并遵循法定程序。
详细分析如下：
一、执行时效的一般规定
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。这意味着，如果民事案件的判决或裁定生效后，超过二年未申请执行，且在此期间没有发生时效中止或中断的情形，那么该案件的执行时效通常会被认为已经届满。
二、二十多年民事案件的执行异议问题
执行时效届满的影响：
- 如果二十多年的民事案件已经超过了申请执行的二年期间，且没有时效中止或中断的情形，那么从法律上讲，该案件的执行时效已经届满。此时，即使提出执行异议，也难以直接启动或恢复执行程序。
特殊情形的考虑：
- 还款协议的重新确认：如果当事人双方在执行时效届满后达成了还款协议，这可能构成对原债务的重新确认。根据相关法律规定，这种情况下，原债务的诉讼时效会重新计算，从而可能影响执行时效的计算。但需注意，这种重新确认需要明确的书面协议或其他充分证据支持。
- 新财产线索的发现：如果发现被执行人有新的财产线索，且该财产线索在原执行程序中未被发现或处理，那么可以尝试以此为由提出执行异议或申请恢复执行。但需提供充分证据证明该财产线索的存在及其与原案件的关联性。
- 原执行程序违法违规：如果原执行程序存在违法违规行为，如执行人员滥用职权、徇私舞弊等，那么可以以此为由提出执行异议或申请撤销原执行裁定。但需提供充分证据证明原执行程序的违法违规行为。
三、处理建议
审查案件材料：
- 首先，需要仔细审查原民事案件的判决书、裁定书以及执行过程中的相关材料，了解案件的具体情况、执行时效的计算以及是否存在特殊情形。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但基于问题背景，我作为郑学滨律师可直接提供咨询）：
- 鉴于执行异议和恢复执行程序的复杂性，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见。作为专注于房屋拆迁、土地纠纷、行政纠纷等领域的律师，我也可以为你提供相关领域的法律咨询。
准备充分证据：
- 如果决定提出执行异议或申请恢复执行，需要准备充分证据支持自己的主张。这可能包括还款协议、新财产线索的证据、原执行程序违法违规的证据等。
遵循法定程序：
- 提出执行异议或申请恢复执行需要遵循法定程序。这可能包括向法院提交书面申请、参加听证会、提供证据等。务必确保所有步骤都符合法律规定，以提高申请的成功率。
最后，二十多年的民事案件是否可提出执行异议及如何处理，取决于案件的具体情况、执行时效的计算以及是否存在特殊情形。如果你对此有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。