针对您提出的“对方的钱大部分在公司怎么办”这一问题，这通常涉及到对方财产与公司财产的混同、公司债务承担以及可能的法律救济途径等多个方面。以下是我从不同角度为您进行的分析和建议：
一、财产混同的法律风险
公司法人人格否认：如果对方作为公司股东或实际控制人，将其个人财产与公司财产混同，导致公司无法独立承担民事责任，根据《公司法》的相关规定，债权人可以请求法院否认公司的法人人格，要求股东或实际控制人对公司债务承担连带责任。这意味着，如果对方的钱大部分在公司，且存在财产混同的情况，您有可能通过法律途径要求对方以个人财产偿还公司债务。
证据收集：要证明财产混同，您需要收集相关证据，如公司财务账簿、银行流水、交易合同等，以证明对方将个人财产与公司财产混同使用，且这种混同导致了公司无法独立承担民事责任。
二、公司债务的承担
公司独立责任：一般情况下，公司以其全部财产对公司的债务承担责任，股东仅以其出资额为限对公司承担责任。如果对方的钱大部分在公司，且这些钱属于公司财产，那么您应当通过法律途径向公司主张债权，而不是直接向对方个人主张。
特殊情况下的个人责任：除了上述公司法人人格否认的情况外，如果对方作为公司股东或董事、高管等存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，根据《公司法》的规定，您也可以要求其对公司债务承担连带责任。
三、法律救济途径
诉讼：如果您认为对方存在财产混同或滥用公司法人独立地位等行为，导致您的债权无法得到实现，您可以向法院提起诉讼，要求对方承担相应的法律责任。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持您的主张。
协商与调解：在诉讼之前或诉讼过程中，您也可以尝试与对方进行协商或调解，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于节省诉讼成本和时间，同时也有助于维护双方的关系。
四、实际操作建议
咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，我建议您直接向我咨询。我可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
谨慎行事：在采取任何法律行动之前，请确保您已经充分了解了相关法律规定和可能的风险。不要盲目行事，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
综上所述，针对“对方的钱大部分在公司怎么办”这一问题，您需要根据具体情况判断是否存在财产混同或滥用公司法人独立地位等行为，并据此选择合适的法律救济途径。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。