“工厂旷工一天扣三天工资”的做法是不合法的，劳动者有权依法维护自己的合法权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律规定角度
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《工资支付暂行规定》第十六条也明确指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
扣款合法性判断：
- 若劳动合同或规章制度未明确旷工扣款的具体规则，或扣款比例超过法定上限（如日薪的三倍），则属于违法克扣工资。
- 合法扣款需满足制度公示、扣款比例合理（不超过月薪20%）、剩余工资不低于最低标准三项条件。
二、公司规章制度与合同审查
制度有效性审查：
- 确认规章制度是否经民主程序制定并公示，未经员工签字确认或未公示的制度条款无效。
- 检查劳动合同中是否明确约定旷工扣款规则，若无约定则企业无权单方扣款。
争议条款分析：
- 若制度规定“旷工一天扣三天工资”，需结合行业特性、岗位性质及实际损失评估合理性。例如，对生产连续性要求高的岗位，可适当提高扣款比例，但仍需符合法律上限。
三、劳动者应对措施
与公司协商沟通：
- 主动沟通：以书面形式提出异议，引用具体法律条款说明扣款违法性。
- 要求提供依据：要求公司提供扣款依据，包括经济损失证明、制度公示记录等。
- 协商解决方案：建议按实际缺勤天数扣款，或通过补班、绩效扣分等方式替代罚款。若涉及重大误解或显失公平，可主张撤销扣款决定。
寻求外部帮助：
- 劳动监察投诉：向当地人力资源和社会保障局劳动监察部门提交书面投诉材料，附证据清单（工资条、考勤记录、制度文件等）。
- 申请劳动仲裁：准备仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明及扣款凭证。可主张返还违法扣款、支付经济补偿金（若因此解除劳动合同）。
- 法律诉讼途径：对仲裁结果不服的，可在15日内向法院提起诉讼，需提供新证据支持诉求。
保留关键证据：
- 证据收集要点：保存劳动合同、工资单、考勤记录原件；收集制度培训签到表、电子邮件通知等公示证明；记录协商过程（录音需征得对方同意）。
- 证据保存建议：使用云存储备份电子证据，纸质文件扫描存档，避免原件丢失。
四、后续预防措施
- 完善合同管理：签订劳动合同时，仔细审阅扣款相关条款，拒绝签署空白合同。
- 关注制度更新：定期查阅公司公告栏或内部系统，及时获取制度修订信息。
- 提升法律意识：参加劳动法规培训，关注典型案例，增强自我保护能力。
示例说明：
假设某劳动者月工资为5000元，当地月最低工资标准为2000元。若该劳动者旷工一天，工厂按“旷工一天扣三天工资”的规定扣除其1500元（假设日薪为500元），则此扣款行为违法。因为即使劳动者旷工给工厂造成损失，工厂每月从其工资中扣除的部分也不得超过1000元（5000元的20%），且扣除后剩余工资不得低于2000元。在此情况下，劳动者有权要求工厂返还违法扣除的500元，并可通过劳动监察投诉、申请劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。
综上所述，面对“工厂旷工一天扣三天工资”的不合法做法，劳动者应依法维权，确保自己的合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。