公司跟包工头签的免责协议是否有效，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 协议内容合法性：

   • 如果免责协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该协议是无效的。例如，如果协议中约定公司对包工头因故意或重大过失造成的损害不承担责任，这种约定可能因违反法律原则而被认定为无效。
   • 如果协议内容合法，且双方意思表示真实，没有欺诈、胁迫等情形，那么协议在形式上可能是有效的。但即便如此，其实际效力还需结合其他因素综合判断。

2. 协议双方主体资格：

   • 公司作为法人，具有签订合同的主体资格。但包工头如果是个体经营者或没有相应资质的个人，其签订免责协议的能力可能受到限制。特别是当包工头不具备承担相应责任的能力时，即使签订了免责协议，也可能因主体不适格而导致协议无效或部分无效。

3. 协议是否损害第三方利益：

   • 如果免责协议的内容损害了第三方的合法权益，如包工头雇佣的工人的权益，那么该协议可能因损害第三方利益而被认定为无效。因为法律保护第三方的合法权益不受侵害，任何试图通过协议免除对第三方责任的行为都可能受到法律的限制。

4. 协议的实际履行情况：

   • 即使免责协议在形式上合法有效，但如果在实际履行过程中，公司存在过错或违法行为，导致损害发生，那么公司仍可能需承担相应的法律责任。因为免责协议不能成为公司逃避法律责任的“护身符”，特别是在公司存在过错或违法行为的情况下。

法律建议：

• 在签订免责协议前，公司应仔细审查协议内容，确保不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
• 公司应核实包工头的主体资格和资质情况，确保其具备签订和履行协议的能力。
• 公司应考虑协议是否可能损害第三方的合法权益，避免因此引发法律纠纷。
• 在实际履行过程中，公司应严格遵守法律法规和协议约定，避免因过错或违法行为导致损害发生。

可能后果：

• 如果免责协议被认定为无效或部分无效，公司可能需承担相应的法律责任，包括赔偿损失等。
• 如果因免责协议引发法律纠纷，公司可能需投入大量时间和精力进行应对，甚至可能影响公司的声誉和正常运营。

因此，公司在与包工头签订免责协议时，应谨慎对待，确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。