结论：公司以甲方不满意员工工作能力为由辞退员工是否合法，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合法辞退的情形
有明确证据证明员工不胜任工作：
- 根据《劳动合同法》第四十条第二项规定，劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同。
- 关键点：公司需提供充分证据证明员工确实不胜任工作，如绩效考核记录、工作失误记录等，并且已经对员工进行了培训或调整工作岗位，但员工仍无法胜任。
劳动合同或规章制度中有明确约定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工不胜任工作的具体标准和辞退程序，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，公司可以按照约定辞退员工。
- 关键点：劳动合同或规章制度中的规定必须合法、合理，且已经向员工公示或告知。
二、非法辞退的情形
无充分证据证明员工不胜任工作：
- 如果公司仅凭甲方的主观评价或感觉，没有提供客观、充分的证据证明员工不胜任工作，就辞退员工，这种行为可能构成违法辞退。
- 后果：员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
未履行法定程序：
- 即使公司有证据证明员工不胜任工作，但如果未按照《劳动合同法》的规定提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资，就辞退员工，这种行为也构成违法辞退。
- 后果：员工同样有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
基于歧视性原因辞退：
- 如果公司以甲方不满意员工工作能力为由，但实际上是因为员工的性别、年龄、种族、宗教信仰等歧视性原因而辞退员工，这种行为不仅违法，还可能构成侵权。
- 后果：员工有权要求公司承担侵权责任，并可能获得精神损害赔偿。
三、建议与措施
对于公司：
- 在辞退员工前，务必确保有充分证据证明员工不胜任工作，并已经履行了法定程序。
- 完善劳动合同和规章制度，明确员工不胜任工作的具体标准和辞退程序，并向员工公示或告知。
- 在辞退过程中，保持客观、公正的态度，避免歧视性行为。
对于员工：
- 如果认为公司辞退行为违法，可以收集相关证据，如劳动合同、工资单、绩效考核记录等，向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
- 在维权过程中，保持冷静、理性，避免采取过激行为。
总结：公司以甲方不满意员工工作能力为由辞退员工是否合法，取决于是否有充分证据证明员工不胜任工作、是否履行了法定程序以及是否存在歧视性原因。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。