备孕期间上夜班是否合法，不能一概而论，需结合具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是从不同角度进行的分析：
法律法规层面：
- 根据我国《劳动法》的相关规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息一日，且应合理安排工作时间和休息时间，避免对劳动者的身体健康造成不利影响。虽然法律没有直接规定备孕期间女性不能上夜班，但如果上夜班对备孕女性的身体健康产生了明显的不良影响，如导致生物钟紊乱、内分泌失调等，那么用人单位可能需要考虑调整其工作时间或提供必要的健康保障措施。
- 另外，如果备孕女性属于《女职工劳动保护特别规定》中保护的对象（如孕期、产期、哺乳期的女职工），那么用人单位应遵守该规定中的相关条款，如不得安排女职工在孕期从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动，对怀孕七个月以上的女职工，不得安排其延长工作时间和夜班劳动等。虽然备孕期间尚未怀孕，但用人单位也应考虑到备孕女性的特殊生理状况，给予适当的照顾。
劳动合同和公司规章制度层面：
- 劳动合同是用人单位与劳动者之间约定权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了备孕期间女性不得上夜班或用人单位需提供特殊照顾等条款，那么双方应遵守这些约定。
- 公司规章制度也是用人单位管理劳动者的重要依据。如果公司规章制度中有关于备孕期间女性工作时间的特殊规定，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位和劳动者也应遵守这些规定。
实际情况和个体差异层面：
- 备孕期间女性的身体状况因人而异，有些女性可能能够适应夜班工作，而有些女性则可能因夜班工作而感到身体不适。因此，用人单位在安排备孕女性工作时，应充分考虑其个体差异和身体状况，给予必要的照顾和调整。
- 如果备孕女性因上夜班而出现了身体健康问题，如失眠、焦虑、内分泌失调等，且这些问题与上夜班有直接因果关系，那么用人单位可能需要承担相应的法律责任。
建议：
- 对于备孕期间的女性来说，如果上夜班对身体健康产生了不良影响，建议及时与用人单位沟通，说明自己的身体状况和需求，争取调整工作时间或获得必要的健康保障措施。
- 用人单位在安排备孕女性工作时，也应充分考虑其特殊生理状况和需求，给予适当的照顾和调整，以维护劳动者的合法权益和身体健康。
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