个独企业法人死亡后由其儿子继承，需按以下步骤操办：

1. 确认继承权
   首先需明确儿子作为继承人的法律地位。根据《民法典》继承编，若法人（即个人独资企业的投资人）去世，其遗产（包括个人独资企业的财产权益）由法定继承人或遗嘱继承人继承。若法人留有合法遗嘱，需按遗嘱执行；若无遗嘱，则按法定继承顺序（配偶、子女、父母为第一顺序继承人）确定继承人。儿子作为第一顺序继承人，需与其他继承人（如配偶、其他子女等）协商或通过法律程序确认继承份额。

2. 办理继承公证
   继承人需携带法人死亡证明、亲属关系证明、遗嘱（如有）、企业财产清单等材料，到公证处办理继承权公证。公证处会核实继承人身份、继承份额及企业财产状况，并出具《继承权公证书》。此步骤是后续变更登记的关键依据，不可省略。

3. 变更个人独资企业登记
   根据《个人独资企业法》第十七条，投资人死亡且无继承人或继承人放弃继承的，企业应当解散；若有继承人继承，企业应向登记机关申请变更投资人。具体流程为：

   • 填写《个人独资企业变更登记申请书》，提交继承权公证书、新投资人身份证明、企业营业执照等材料；
     
   • 登记机关审核通过后，换发新营业执照，完成投资人变更登记。
     注意：若企业名称、经营范围等需同步变更，需一并提交相关申请。

4. 处理企业债务与税务

   • 债务承担：根据《个人独资企业法》第二条，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任。继承人在继承企业财产的同时，也需在继承范围内承担企业债务。若继承人放弃继承，则对企业债务不承担责任。
     
   • 税务清算：需向税务机关申报法人死亡后的企业所得税、个人所得税等税务清算，确保税款结清。若企业存在未了结的税务问题，继承人需配合处理。

5. 其他实务操作

   • 银行账户变更：持新营业执照、公章等材料，到银行变更企业账户信息，确保资金流转正常。
     
   • 合同与许可更新：检查企业正在履行的合同及经营许可（如许可证、资质证书等），若需变更主体，及时办理相关手续。
     
   • 员工安置：若企业有员工，需根据《劳动合同法》处理劳动关系变更或终止事宜，避免劳动纠纷。

特殊情形提示：

• 若个独企业涉及特殊行业（如金融、医疗等），可能需额外取得行业主管部门的批准或备案。
  
• 若企业财产与法人个人财产混同，需先通过审计或诉讼厘清财产边界，再办理继承。
  

建议：继承过程涉及法律、税务、工商等多环节，建议继承人提前梳理企业财产与债务，咨询专业人士协助办理，以降低风险。如有具体问题，可直接向我提问，我会结合实际情况为您详细解答。