结论：公司因快递员国补订单拍照片不合格而罚款是否合法，需分情况讨论，不能一概而论。具体分析如下：

1. 若公司罚款有明确的规章制度依据，且规章制度合法有效
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定有关劳动报酬、工作时间、劳动纪律等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，需经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，并与工会或职工代表平等协商确定。若公司能证明其罚款制度已履行上述民主程序，且内容不违反法律、行政法规及政策规定（如罚款金额未超过月工资的20%），则罚款可能被认定为合法。但需注意，罚款需以实际损失为前提，若照片不合格未造成公司实际损失，仅以“管理需要”为由罚款，可能涉嫌违法。

2. 若公司罚款无制度依据或制度违法
   若公司未制定相关规章制度，或制度未经过民主程序、未公示告知劳动者，或罚款金额超出法定标准（如超过月工资20%），则罚款行为违法。此外，根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过月工资的20%。若照片不合格未被认定为“造成经济损失”，公司无权直接罚款。

3. 若罚款属于变相克扣工资
   即使公司有制度依据，若罚款导致劳动者工资低于当地最低工资标准，或以罚款形式替代正常管理（如通过罚款实现“盈利”），则可能被认定为变相克扣工资，违反《劳动法》第五十条关于“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠”的规定。

建议：

• 快递员可要求公司出示罚款的制度依据及民主程序证明（如职工代表大会记录、公示照片等）；
  
• 若公司无法提供，或罚款金额、方式违法，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁；
  
• 公司若需规范管理，建议通过培训、绩效扣分（不涉及工资）等方式替代罚款，以降低法律风险。
  

如有进一步细节（如公司制度内容、罚款金额、是否造成损失等），可继续向我咨询，我会结合具体情况为您详细分析。