劳动合同不合规时，员工补偿金的标准需根据不合规的具体情形及实际损害结果综合判断，主要分为以下几种情况：

1. 劳动合同无效或部分无效的情形
   若劳动合同因违反法律强制性规定（如未约定社保、约定试用期违法、未明确劳动报酬等）被认定无效或部分无效，根据《劳动合同法》第二十八条，员工有权要求用人单位按实际履行情况支付劳动报酬；若因无效条款导致员工损失（如未缴纳社保导致无法享受医保待遇），员工可主张赔偿实际损失。
   例如：合同约定“不缴纳社保”，员工因病住院无法报销医疗费，可要求用人单位赔偿该部分损失。

2. 用人单位违法解除或终止劳动合同的情形
   若用人单位以“劳动合同不合规”为由单方解除合同，但解除行为本身违法（如未履行法定程序、无合法理由），根据《劳动合同法》第四十八条、第八十七条，员工可要求继续履行合同或主张赔偿金，赔偿金标准为经济补偿金的2倍（即“2N”）。
   经济补偿金计算方式：按员工在本单位工作年限，每满1年支付1个月工资；6个月以上不满1年的按1年计算；不满6个月的支付半个月工资。月工资高于当地社平工资3倍的，按3倍封顶计算，且年限最高不超过12年。
   例如：员工工作3年，月工资1万元（未超社平工资3倍），违法解除时赔偿金为6万元（3×2×1万）。

3. 劳动合同未签订或未交付书面合同的情形
   若用人单位未与员工签订书面劳动合同，根据《劳动合同法》第八十二条，员工可主张自用工次月起至满1年前的双倍工资差额（最多11个月）；若未交付劳动合同文本，员工可要求用人单位交付，但无直接补偿金，但可据此主张用人单位管理违规。
   例如：员工入职5个月未签合同，可主张4个月双倍工资差额（第2-5个月）。

4. 其他不合规情形（如违约金条款违法、竞业限制补偿未约定等）

   • 若合同中约定“服务期违约金”但未提供专项培训费用，或约定“竞业限制”但未支付补偿金，员工可主张相关条款无效，并拒绝履行义务；
     
   • 若用人单位未支付加班费、未安排年假等，员工可依据《劳动法》《职工带薪年休假条例》等要求补发工资或支付未休年假工资（日工资的200%-300%）。

行动建议：

1. 收集证据：保留劳动合同文本、工资条、考勤记录、解除通知等材料；
   
2. 协商或投诉：先与用人单位协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁；
   
3. 计算补偿：根据具体情形对照上述标准计算应得补偿，避免遗漏项目。
   

若涉及复杂情形（如高薪员工补偿封顶、混合过错等），建议进一步提供细节，我会为您详细分析。