在建设工程代位权诉讼中，若承包人也主张工程款，可按以下方式处理：

1. 明确代位权诉讼与承包人主张工程款的关系

   • 代位权诉讼是债权人（如材料供应商、设备租赁商等）因债务人（如建设单位）怠于行使其到期债权，对债务人造成损害时，债权人以自己的名义代位行使债务人对第三人（如承包人）的权利。若承包人也主张工程款，这通常意味着承包人与建设单位之间存在工程款支付纠纷，且该纠纷与代位权诉讼中的债权存在关联。
   • 处理原则：在此情况下，法院会首先审查代位权诉讼的合法性，即债权人是否具备代位行使债务人权利的条件。同时，也会关注承包人主张工程款的合法性及依据，确保各方权益得到公平保护。

2. 合并审理或分别审理的选择

   • 合并审理：若承包人主张的工程款与代位权诉讼中的债权紧密相关，且合并审理有助于查明事实、提高效率，法院可能会选择合并审理。这有助于全面梳理各方之间的债权债务关系，避免重复诉讼，减少司法资源浪费。
   • 分别审理：若承包人主张的工程款与代位权诉讼中的债权相对独立，或合并审理可能导致案件过于复杂、审理周期过长，法院可能会选择分别审理。这有助于确保每个案件都能得到充分、细致的审理，保障各方当事人的诉讼权利。
   • 处理建议：作为律师，我会建议当事人根据案件具体情况，向法院提出合并审理或分别审理的申请，并充分阐述理由。同时，也会协助当事人准备相关证据材料，以支持其主张。

3. 工程款优先受偿权的考虑

   • 在建设工程领域，承包人通常享有工程款优先受偿权。这意味着在建设单位拖欠工程款的情况下，承包人有权就其承建的工程部分优先于其他债权人受偿。
   • 处理原则：在代位权诉讼中，若承包人也主张工程款，法院会考虑工程款优先受偿权的因素。若承包人能够证明其享有优先受偿权，且该权利未因其他原因而丧失或受限，法院可能会在判决中予以体现。
   • 处理建议：作为律师，我会协助承包人收集、整理相关证据材料，以证明其享有工程款优先受偿权。同时，也会在诉讼过程中积极主张该权利，以维护承包人的合法权益。

4. 调解与和解的可能性

   • 在诉讼过程中，各方当事人也可以考虑通过调解或和解的方式解决纠纷。这有助于节省诉讼成本、缩短诉讼周期，并促进各方之间的和谐合作。
   • 处理建议：作为律师，我会在诉讼过程中积极与各方当事人沟通协商，寻求调解或和解的可能性。若各方能够达成一致意见，我会协助起草调解协议或和解协议，并确保其合法有效。

在处理此类案件时，建议当事人及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。