结论：在被告向经营部拿货的情况下，起诉时能否以经营部经营者作为原告起诉，需根据具体情况判断，一般情况下，若经营部为个体工商户，可以以经营者名义起诉；若经营部为公司或其他组织形式，则应以经营部本身或公司名义起诉。以下从不同角度进行详细分析：
一、经营部为个体工商户的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五十四条：“自然人从事工商业经营，经依法登记，为个体工商户。个体工商户可以起字号。”
- 个体工商户在法律上被视为自然人的一种特殊形态，其民事权利和义务由经营者个人享有和承担。
法律建议：
- 若经营部为个体工商户，且未起字号或虽起字号但未在法律文书中明确区分，那么在起诉时，可以直接以经营部经营者的名义作为原告。
- 若经营部已起字号，并在法律文书中明确区分，理论上应以字号作为原告，但在实际操作中，由于个体工商户的特殊性，法院往往也会接受以经营者名义起诉，但需注意在起诉状中明确说明经营部的个体工商户性质及经营者身份。
二、经营部为公司或其他组织形式的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司或其他组织形式（如合伙企业、个人独资企业等）具有独立的法律人格，其民事权利和义务由公司或组织本身享有和承担。
- 在这类情况下，经营部作为公司或组织的一个部门或分支机构，其民事行为后果应由公司或组织本身承担。
法律建议：
- 若经营部为公司或其他组织形式的一个部门或分支机构，那么在起诉时，应以公司或组织本身的名义作为原告，而非经营部经营者个人。
- 若经营部具有独立的法人资格（如子公司），则应以该独立法人作为原告。
三、特殊情况考虑
合同相对性原则：
- 在合同纠纷中，应遵循合同相对性原则，即合同的权利和义务应由合同双方当事人享有和承担。
- 若被告是与经营部签订的合同，而非与经营者个人签订，那么在起诉时，应以合同的一方当事人（即经营部或其所属的公司/组织）作为原告。
实际经营情况：
- 在某些情况下，经营部可能并未进行合法的工商登记，或存在其他复杂的经营情况。
- 这时，需要根据实际经营情况、合同签订情况、资金往来情况等多方面因素综合判断，以确定合适的原告主体。
进一步思考：在决定以谁作为原告起诉时，除了考虑上述法律因素外，还应考虑实际诉讼的便利性、证据收集的难易程度、诉讼成本等因素。例如，若以经营者个人名义起诉可能更便于证据收集和诉讼进行，但需确保符合法律规定的原告主体资格。因此，在具体操作中，建议根据实际情况咨询专业律师，以制定最合适的诉讼策略。
最后，若您在此类问题上仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。