农村耕地确权原则上以实际测量面积为准，但在特定情况下也会综合考虑承包合同面积，具体分析如下：
一、以实际测量面积为准的情况
确权原则与目的：
- 农村土地确权的核心目的是明确土地权益，保障土地权利人的合法权益。通过实地勘测，可以准确确定土地的实际占用范围和面积大小，为确权提供可靠依据。
测量方法与流程：
- 在实际操作中，会使用GPS等先进测量仪器对土地边界和面积进行精确测量。对于形状不规则的土地，会采用分段测量、分割计算的方法确保准确性。
- 测量结果会经过公示、确认等程序，确保确权工作的透明度和公正性。农民群众对勘测结果有异议的，可以提出申诉并要求重新勘测。
特殊情况处理：
- 若实际测量面积与合同面积存在较大误差，且该误差经过严格的调查、公示等合法程序得到认定，核实实际面积情况后，会按照实际面积进行确权。例如，因河流改道导致耕地面积增加的情况，就需经过相关部门现场勘查、村民见证等程序后，以新的实际面积进行确权。
二、综合考虑承包合同面积的情况
合同面积的基础性作用：
- 在土地实际使用状况与土地承包合同等合同约定相符，且无争议的情况下，通常会按照合同面积进行确权登记。合同作为土地权益的初始依据，其约定的面积、四至等条款具有法律效力，有助于维护土地权益关系的稳定性。
面积误差的合理范围：
- 由于测量技术、土地状况等因素，允许测量面积与二轮承包合同面积存在一定的合理误差。只要误差在规定范围内（一般不超过5%），通常以实际测量面积为准进行确权登记。但如果误差超出这个范围，就需要进一步核实情况，查找原因，并按照当地规定进行处理。
合同面积明显错误的处理：
- 当有充分证据证明合同面积登记有误，如合同签订时的记录失误，通过查阅原始测量资料、证人证言等证据能够证实实际面积与合同面积不符时，应纠正错误，并按照实际面积进行确权。
三、实际操作中的建议
了解当地政策：
- 不同地区在农村土地确权方面可能存在细微差异，因此建议农民群众在确权前了解当地的具体政策和规定。
保留相关证据：
- 在确权过程中，农民群众应保留好与土地相关的所有证据，如承包合同、土地台账、经营权证等，以便在需要时提供证明。
及时咨询与申诉：
- 如果农民群众对确权结果有异议，应及时向当地土地管理部门咨询或提出申诉。作为专业律师，我也可以为你提供法律咨询和帮助，确保你的合法权益得到保障。
总结来说，农村耕地确权是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。在大多数情况下，实测面积因其准确性和反映土地现状的特点，成为确权登记的主要依据。然而，在特定情况下，如合同面积与实际面积相差不大且无争议，或合同面积存在明显错误但已得到纠正时，也会考虑以合同面积进行确权。如果你在农村耕地确权方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。