当遇到土地实测面积和承包面积不一致的情况时，确权工作需要综合考虑历史背景、现实情况以及法律法规，以确保处理方案的公平、公正和合法。以下是一个详细且深入的处理流程：

一、核实测量数据的准确性

首先，要确保实测面积的准确性。可以委托专业的测量单位，采用先进的技术手段（如数字化地图、卫星遥感等）进行重新测量。同时，要调查面积差异的原因，这可能包括测量误差、土地自身变化（如水土流失、地形改变等）或承包合同记载有误等。

二、公示与调查

将实测面积进行公示，公示期应不少于15天，以便让村民充分了解情况并提出异议。同时，组织相关人员对面积差异进行调查核实，确保事实清楚、证据确凿。这一步骤是确保透明度和公正性的重要环节。

三、分类处理差异

根据面积差异的大小和原因，进行分类处理：

1. 误差在合理范围内（如±5%）：如果差异在合理范围内，且经发包方和承包方认可，可以按实测面积进行确权登记，并在相关文件上注明面积差异。

2. 差异较大：

   • 如果差异是由于土地自身变化导致的，应经村民会议或代表会议讨论通过后，调整承包面积并重新签订合同。
   • 如果差异是由于测量误差或承包合同记载有误导致的，应以实测面积为准进行确权登记，并修正相关档案资料。

四、签订补充协议或重新签订合同

根据双方协商结果，签订补充协议明确面积调整情况，或重新签订承包合同以确保双方权益。同时，办理承包经营权证书更换和登记簿变更登记，确保权属证明的准确性。

五、依法进行登记和更正

依据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，依法进行土地承包面积的登记和更正。提交必要的证明文件，如土地证原件、能证明登记错误的证据资料等，申请更正登记。这一步骤是确保土地权益合法性的关键。

六、纠纷处理

如果在处理过程中出现纠纷，应首先通过协商解决争议，寻求达成一致意见。协商不成时，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，或对仲裁裁决不服时向人民法院提起诉讼。

七、尊重历史和村民集体协商

对于特殊地块或牵扯农户较多的情况，应经由村集体全体成员协商达成一致意见。确保处理过程符合程序正义原则，避免留下纠纷隐患。

法律依据

在处理过程中，应严格遵循《中华人民共和国土地管理法》第十二条的规定，即土地的所有权和使用权的登记应依照有关不动产登记的法律、行政法规执行，受法律保护。同时，也要参考相关地方性法规和政策文件，结合当地实际情况进行具体操作。

综上所述，处理土地实测面积和承包面积不一致的问题时，需要综合考虑多方面因素，遵循相关法律法规和政策规定，确保处理方案的合法性、合理性和可操作性。通过这样的流程，可以确保农民的土地权益得到准确和合法的确认。