交警在公路上查尾气是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国大气污染防治法》的相关规定，县级以上地方人民政府生态环境主管部门可以在机动车集中停放地、维修地对在用机动车的大气污染物排放状况进行监督抽测；在不影响正常通行的情况下，也可以通过遥感监测等技术手段对在道路上行驶的机动车的大气污染物排放状况进行监督抽测，公安机关交通管理部门予以配合。这表明，交警部门在配合生态环境主管部门进行尾气检查时，是有明确的法律依据的，其检查行为是合法的。

执法目的

交警查尾气的主要目的是为了减少机动车尾气排放对大气环境的污染，保护公众健康。随着汽车保有量的不断增加，机动车尾气排放已成为城市空气污染的主要来源之一。通过查尾气，可以及时发现并纠正超标排放的车辆，从而有效减少污染物排放，改善空气质量。

执法程序

在查尾气的过程中，交警部门通常会遵循一定的执法程序。例如，他们会使用专业的检测设备对车辆的尾气排放进行检测，并出具检测报告。如果检测结果显示车辆尾气排放超标，交警部门会依法对车主进行处罚，并要求车主对车辆进行维修或整改，以确保车辆尾气排放符合国家标准。

车主权益

虽然交警查尾气是合法的，但车主也享有相应的权益。例如，车主有权要求交警部门出示合法的执法证件和检测设备，以确保检查的合法性和准确性。如果车主对检测结果有异议，可以依法申请复检或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

特殊情况

在某些特殊情况下，交警查尾气的行为可能会受到一定的限制。例如，在交通拥堵或事故多发路段，交警部门可能会优先保障交通畅通和安全，而暂时减少或暂停尾气检查。但这并不意味着交警部门不能在这些路段进行尾气检查，只是需要根据实际情况进行灵活调整。

建议：作为车主，我们应该积极配合交警部门的尾气检查工作，确保自己的车辆尾气排放符合国家标准。同时，我们也可以定期对自己的车辆进行维护和保养，减少尾气排放对环境的污染。如果你对交警查尾气的行为有任何疑问或异议，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。