结论：员工因透析请假，用人单位一般不应扣工资，但具体还需根据请假性质、公司规章制度及法律法规综合判断。
分析说明：
透析属于医疗期范畴：
- 透析通常是尿毒症等严重疾病的治疗方式，员工因透析需要请假，应视为因患病或非因工负伤需要停止工作医疗的情形。
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同，且应按照规定支付病假工资或疾病救济费。
病假工资的支付：
- 病假工资的支付标准通常由公司规章制度或劳动合同约定，但不得低于当地最低工资标准的80%。
- 如果公司规章制度或劳动合同中没有明确规定，那么应参照相关法律法规，确保员工在医疗期内获得合理的工资待遇。
公司规章制度的影响：
- 如果公司规章制度中明确规定了透析等特殊医疗情况的请假和工资支付方式，且该规定不违反法律法规，那么应按照公司规章制度执行。
- 但公司规章制度不得剥夺员工在医疗期内应享有的合法权益，如病假工资等。
特殊情况下的处理：
- 如果员工因透析需要长期请假，且公司无法承担其工资支出，双方可以协商解除劳动合同，并按照规定支付经济补偿。
- 但这种情况下，公司应确保解除劳动合同的合法性和合理性，避免侵犯员工的合法权益。
法律建议：
员工方面：
- 在请假前，应了解公司规章制度和劳动合同中关于病假和工资支付的规定。
- 如果公司规章制度或劳动合同中没有明确规定，可以与公司协商确定病假工资的支付方式和标准。
- 如遇公司违法扣减工资，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
公司方面：
- 应制定完善的公司规章制度，明确病假和工资支付的相关规定。
- 在处理员工因透析请假的情况时，应确保遵守相关法律法规和公司规章制度。
- 如需与员工协商解除劳动合同，应确保协商的合法性和合理性，避免引发劳动争议。
后续行动：
- 如果您或您的公司遇到类似情况，建议首先查阅公司规章制度和劳动合同中关于病假和工资支付的规定。
- 如需进一步了解相关法律法规或处理劳动争议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。