结论概述：
针对您提出的问题，即没有实际注资的公司中，一个股东要退出而另一个不同意且不配合办理工商变更手续的情况，这主要涉及到股东权利、义务以及公司股权变更的法律程序。以下是从不同角度对此问题的详细分析。
一、股东权利与义务的角度
股东权利：
- 股东有权按照其出资比例或公司章程的规定，分享公司利润，参与公司决策等。
- 在公司未实际注资的情况下，股东的权利可能受到一定限制，但这并不意味着股东完全丧失权利。股东仍享有知情权、监督权等基本权利。
股东义务：
- 股东有义务按照约定出资，这是股东对公司最基本的义务。
- 若股东未实际出资，可能面临对公司债务的补充赔偿责任等法律风险。但在此案例中，主要关注的是股东退出的权利与程序。
二、股东退出的法律程序
协商退出：
- 股东之间可以通过协商达成一致，签订股权转让协议或其他相关协议，明确退出的条件、方式等。
- 若另一股东不同意退出，但双方仍可尝试通过协商找到解决方案，如调整退出条件、引入第三方调解等。
法定退出：
- 在特定情况下，股东可以依据公司法或公司章程的规定，通过法定程序退出公司。例如，当公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利且符合分配利润条件时，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权。
- 但在此案例中，由于公司未实际注资，可能不满足上述法定退出的具体条件。因此，更可能的是通过协商或诉讼方式解决。
诉讼退出：
- 若协商无果，退出股东可以考虑通过诉讼方式解决。这通常涉及确认股东资格、解除股东身份、要求公司办理工商变更登记等诉讼请求。
- 诉讼过程中，法院将根据双方提供的证据和法律规定，判断股东是否有权退出以及公司是否应办理工商变更登记。
三、工商变更登记的法律要求
变更登记的必要性：
- 股东退出后，公司应及时办理工商变更登记，以反映公司股权结构的实际变化。
- 工商变更登记是公司对外公示其股权结构的重要方式，对于保护交易安全、维护市场秩序具有重要意义。
不配合变更登记的法律后果：
- 若另一股东不配合办理工商变更登记，退出股东可以要求公司履行变更登记义务。若公司拒绝或无法履行，退出股东可以向法院提起诉讼，要求法院判决公司办理变更登记。
- 在诉讼过程中，法院可以依法对公司或相关责任人进行处罚，如罚款、拘留等，以促使其履行变更登记义务。
四、建议与措施
尝试协商：
- 首先，建议双方尝试通过协商找到解决方案。这可以节省时间和成本，避免不必要的法律纠纷。
寻求法律援助：
- 若协商无果，退出股东可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权利和义务，以及可能的法律途径和解决方案。
准备诉讼材料：
- 若决定通过诉讼方式解决，退出股东应准备充分的诉讼材料，包括股权转让协议、公司章程、股东会决议等证据，以支持自己的诉讼请求。
关注公司动态：
- 在诉讼过程中，退出股东应关注公司的动态和变化，如公司是否进行其他股权转让、是否涉及诉讼等，以便及时调整自己的诉讼策略。
总结与展望：
股东退出公司是一个复杂的法律问题，涉及股东权利、义务以及公司股权变更的法律程序。在处理此类问题时，建议双方首先尝试通过协商找到解决方案；若协商无果，则可以考虑通过诉讼方式解决。在此过程中，退出股东应充分了解自己的权利和义务，准备充分的诉讼材料，并关注公司的动态和变化。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。