关于自建房盖6层是否合法以及需要特别注意的承重结构和审批手续问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、自建房盖6层是否合法
自建房的合法性主要取决于是否履行了相关的规划和审批手续，以及是否符合当地的建房政策。一般来说，农村自建房的可建设层数由各地根据情况自行规定，通常不允许建三层以上房屋。例如，北京目前就只允许建二层及二层以下的房屋。因此，自建房盖6层在多数情况下是不合法的，除非当地有特别的规定允许建设更高层数的房屋。
二、需要特别注意的承重结构
如果当地政策允许建设更高层数的房屋，那么在建设过程中，您需要特别注意承重结构的设计和施工。承重结构是房屋安全的关键，它直接关系到房屋的稳定性和使用寿命。在建设高层房屋时，您应该：
- 聘请专业设计团队：确保房屋的设计符合建筑规范和安全标准，特别是承重结构的设计要科学合理。
- 选择有资质的施工团队：高层房屋的施工需要专业的技术和经验，选择有相应建筑从业资质的施工团队可以确保施工质量和安全。
- 严格监督施工过程：在施工过程中，您应该密切关注承重结构的施工情况，确保施工符合设计要求，没有偷工减料等行为。
三、需要特别注意的审批手续
无论建设多少层数的房屋，您都需要履行相关的审批手续。具体来说，您需要：
- 申请建设工程规划许可证：在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物建设的，您需要向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。申请时，您需要提交使用土地的有关证明文件、建设工程设计方案等材料。
- 申请乡村建设规划许可证：在乡、村庄规划区内使用原有宅基地进行农村村民住宅建设的，您需要申请并取得《乡村建设规划许可证》。具体申请流程可能因地区而异，但通常包括向村委会递交申请、经过村民小组会议讨论、公示无异议后由村级组织签署意见并报送乡镇主管部门等步骤。
- 办理用地审批手续：在取得乡村建设规划许可证后，您还需要办理用地审批手续，确保土地使用的合法性。
四、其他注意事项
除了上述的承重结构和审批手续外，您还需要注意以下几点：
- 不准未批先建：建房前，您必须先获得相关的审批手续，不得边批边建或未批先建。
- 不准超面积标准建造：农村建房实行“一户一宅”的原则，您需要严格按照审批面积建房，不得超占宅基地。
- 不准随意翻修农房：翻修旧房、危房时，您也需要取得乡村建设规划许可证，并经过审批后才可以动工。
- 不准擅自改变用途：宅基地设置的目的是保障农村村民居住需要，您不得擅自改变用途，比如在宅基地上建设工厂或经营性用房。
综上所述，自建房盖6层在多数情况下是不合法的，且在建设过程中需要特别注意承重结构的设计和施工以及履行相关的审批手续。希望这些解答能够帮助您更好地了解自建房的相关政策和要求。