核心结论：虚开发票的当事人被刑事罚款后，稽查部门仍可能对其公司进行罚款，这是因为刑事处罚与行政处罚是两种不同性质的法律责任，二者可以并行不悖。以下从法律责任性质、处罚依据、处罚对象及程序等角度进行详细分析：

1. 法律责任性质不同

   • 刑事责任：虚开发票行为若构成犯罪（如虚开增值税专用发票罪），当事人将承担刑事责任，包括有期徒刑、罚金等。刑事责任是对行为人最严厉的法律制裁，旨在惩罚犯罪、维护社会秩序。
   • 行政责任：即使当事人已承担刑事责任，若其行为同时违反了税收管理法律法规（如《中华人民共和国税收征收管理法》），税务机关仍有权对其公司进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。行政责任旨在纠正违法行为、维护税收管理秩序。

2. 处罚依据不同

   • 刑事处罚依据：主要依据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，对虚开发票行为构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   • 行政处罚依据：主要依据《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则等税收法律法规，对违反税收管理规定的行为进行处罚。

3. 处罚对象不同

   • 刑事处罚对象：通常是直接负责的主管人员和其他直接责任人员，即实施虚开发票行为的具体个人。
   • 行政处罚对象：是违反税收管理规定的公司或单位，即使个人已承担刑事责任，公司作为独立的法律主体，仍需为其违法行为承担行政责任。

4. 处罚程序不同

   • 刑事处罚程序：需经过公安机关立案侦查、检察机关审查起诉、法院审判等刑事诉讼程序，最终由法院作出判决。
   • 行政处罚程序：由税务机关依法进行调查取证、审查决定、送达执行等行政程序，最终作出行政处罚决定。

建议与应对：

• 公司层面：应积极配合税务机关的调查，主动提供相关资料，说明情况，争取从轻或减轻处罚。同时，加强内部管理，完善发票管理制度，防止类似行为再次发生。
• 个人层面：若当事人已承担刑事责任，应了解行政处罚的具体情况，包括处罚依据、处罚金额等，如有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
• 法律咨询：在处理此类复杂法律问题时，建议及时咨询专业律师，以便更准确地把握法律政策，维护自身合法权益。

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