结论：小区商业区楼下商铺开设小型服装厂是否合法，需结合具体规划用途、是否取得相关许可及是否符合环保、消防等要求综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、规划用途角度
规划用途的确定：
- 小区商业区的规划用途通常会在规划文件或购房合同中明确。若规划用途明确为商业用途，且未禁止开设服装厂等轻工业，则从规划用途角度看，开设小型服装厂可能合法。
- 若规划用途明确为零售、餐饮等特定商业用途，或明确禁止开设工厂，则开设小型服装厂可能违反规划用途，属于违法行为。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，建筑物、构筑物的使用应当符合城乡规划确定的用途。未经批准，不得擅自改变规划用途。
二、许可审批角度
许可审批的必要性：
- 开设小型服装厂，即使位于商业区，也可能需要取得工商营业执照、税务登记证、环保审批、消防审批等相关许可。
- 若未取得相关许可，即使规划用途允许，也可能因缺乏合法手续而被认定为违法经营。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》、《中华人民共和国税收征收管理法》、《中华人民共和国环境保护法》及《中华人民共和国消防法》等相关法律法规，开设工厂需依法办理相关许可手续。
三、环保与消防角度
环保要求：
- 服装厂在生产过程中可能产生噪音、粉尘等污染物，需符合环保部门的相关要求，如安装降噪设备、粉尘收集装置等。
- 若未达到环保要求，可能面临环保部门的处罚，甚至被责令停业整顿。
消防要求：
- 服装厂作为人员密集场所，需符合消防部门的相关要求，如设置消防通道、配备消防器材、进行消防演练等。
- 若未达到消防要求，可能面临消防部门的处罚，甚至引发火灾等安全事故。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国环境保护法》及《中华人民共和国消防法》等相关法律法规，工厂需符合环保和消防要求，确保生产安全。
四、实际操作建议
查询规划用途：
- 向小区物业或当地规划部门查询商业区的规划用途，确认是否允许开设服装厂。
办理相关许可：
- 若规划用途允许，且符合环保、消防等要求，应依法办理工商营业执照、税务登记证、环保审批、消防审批等相关许可手续。
咨询专业人士：
- 在办理许可过程中，可咨询当地工商、税务、环保、消防等部门的专业人士，确保手续齐全、合法合规。
关注邻里关系：
- 开设服装厂可能对周边居民生活产生一定影响，如噪音、交通等。建议与周边居民沟通协商，争取理解与支持。
总结：小区商业区楼下商铺开设小型服装厂是否合法，需综合考虑规划用途、许可审批、环保与消防等多方面因素。若您对此有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细解答。