当起诉单位是分支机构时，可以按照以下思路处理：
- 确认分支机构的诉讼主体资格
根据《民法典》第七十四条及《民事诉讼法》第五十一条，分支机构以自己名义从事民事活动产生的法律责任，先由分支机构财产承担，不足部分由法人承担。因此：
- 若分支机构有独立财产（如分公司领取营业执照、有独立账户），可直接将其列为被告；
- 若分支机构无独立财产（如办事处未领取营业执照），需以设立该分支机构的法人（如总公司）为被告。
关键点：需通过工商登记信息、财务独立证明等材料，核实分支机构是否具备独立诉讼主体资格。
- 起诉时的被告选择策略
- 优先起诉分支机构：若分支机构有偿付能力，直接起诉可提高执行效率（避免追加被告的繁琐程序）；
- 同时起诉分支机构与法人：若分支机构财产不足，可在起诉时将法人列为共同被告，要求其承担补充责任；
- 仅起诉法人：若分支机构已注销或无独立财产，可直接起诉法人，但需提供分支机构注销证明或财产不独立证据。
风险提示：若仅起诉分支机构且其财产不足，可能面临执行困难，需在诉讼中申请追加法人为被执行人。
- 管辖法院的确定
- 分支机构所在地法院：若分支机构有独立诉讼主体资格，可在其住所地起诉；
- 法人住所地法院：若分支机构无独立资格，需到法人住所地法院起诉；
- 合同履行地法院：若争议与合同履行相关，也可选择合同履行地法院（需结合具体案由判断）。
建议：在起诉前通过企业信用信息公示系统查询分支机构与法人的登记信息，明确管辖法院。
- 执行阶段的注意事项
- 若判决分支机构承担责任，执行时可同时查封其财产及法人的财产（需证明财产混同）；
- 若分支机构财产不足，可申请追加法人为被执行人，但需提供法人与分支机构财产不独立的证据（如资金往来记录、财务混同证明）。
总结：起诉分支机构时，需先确认其诉讼主体资格，再根据财产状况选择被告，并在执行阶段灵活运用追加被执行人制度。如有具体案件细节（如分支机构类型、合同内容等），可进一步向我咨询，我会结合案情提供针对性建议。