结论：去当兵后，与原公司签订的协议是否有效，需根据协议的具体内容、性质以及相关法律法规来判断。以下从不同角度进行分析：
协议性质与内容：
- 劳动合同：若与原公司签订的是劳动合同，根据《中华人民共和国兵役法》第五十条：“义务兵和军士入伍前是机关、团体、企业事业组织工作人员的，服役期间保留人事关系或者劳动关系；退出现役后可以选择复职复工”。这意味着，在服役期间，你的劳动关系是被保留的，劳动合同并未因入伍而自动终止或无效。但需注意，若劳动合同中有特别约定，如“因个人原因长期离岗则合同自动解除”等，则可能因入伍而触发此类条款，导致合同效力受影响。不过，此类条款需严格符合法律法规，且通常需双方协商一致，单方面约定可能无效。
- 其他协议：若签订的是非劳动合同性质的协议，如保密协议、竞业限制协议等，这些协议的效力通常不受入伍影响。保密协议在服役期间及退出现役后的一定时间内（根据协议约定）仍需履行保密义务；竞业限制协议则在退出现役后，若满足协议约定的条件（如支付竞业限制补偿金等），则仍需遵守。
法律法规的适用：
- 兵役法：如前所述，《中华人民共和国兵役法》对入伍人员的劳动关系保留有明确规定，这是判断劳动合同是否有效的关键法律依据。
- 劳动合同法：若劳动合同因入伍而面临解除或变更，需依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定进行。例如，若因入伍导致劳动合同无法继续履行，双方可协商解除合同，并依法支付经济补偿。但通常情况下，入伍并不构成劳动合同解除的法定事由。
实际操作建议：
- 与原公司沟通：在入伍前，建议与原公司进行充分沟通，明确入伍期间劳动合同的履行方式、工资待遇、社会保险缴纳等事宜，并尽可能达成书面协议，以避免后续纠纷。
- 保留相关证据：入伍期间，应保留好与原公司的沟通记录、劳动合同、工资单等相关证据，以备不时之需。
- 咨询专业律师：若对协议的效力或后续处理存在疑问，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况提供针对性的法律建议。
可能后果：若未妥善处理与原公司的协议关系，可能导致入伍期间劳动关系纠纷、工资待遇争议、社会保险缴纳问题等。这些问题不仅可能影响你的个人权益，还可能对你的服役状态产生不利影响。因此，建议务必重视并妥善处理与原公司的协议关系。
进一步思考：在入伍前，除了考虑与原公司的协议关系外，还应考虑入伍后的个人发展、职业规划等问题。例如，入伍期间是否继续深造、退出现役后的就业方向等。这些问题同样需要提前规划并做好准备。
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