关于去当兵时与公司签订的协议是否有效的问题，这主要取决于协议的具体内容以及相关法律法规的规定。以下从几个角度进行分析：
协议内容合法性：
- 如果协议内容本身不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该协议在法律上是有效的。例如，协议中约定了你在服役期间公司保留你的职位，或者服役结束后你享有某些特定的权益等，这些内容只要合法，都是有效的。
- 如果协议中存在违法或显失公平的内容，如要求你服役期间继续承担工作义务而不给予任何补偿，或者约定了不合理的违约金等，这些条款可能因违法或显失公平而被认定为无效。
劳动合同法的相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者依法享受社会保险待遇，有权获得劳动安全卫生保护，以及享受带薪年休假等。如果你去当兵，这属于依法服兵役，是公民的义务，同时也是你享受的一项特殊权利。
- 在你服役期间，公司应当保留你的劳动关系，不得随意解除劳动合同。如果你服役期满后希望继续回公司工作，公司应当予以接纳，并恢复你的原职位或提供相当的职位。
协议与法律法规的冲突：
- 如果协议中的某些条款与法律法规相冲突，那么这些条款将被视为无效。例如，如果协议中约定你服役期间公司可以单方面解除劳动合同，这与《中华人民共和国劳动合同法》中关于保护劳动者权益的规定相冲突，因此该条款无效。
- 在这种情况下，你应当依据法律法规的规定来维护自己的权益，而不是仅仅依据协议的内容。
实际操作建议：
- 在你即将去当兵之前，建议你与公司进行充分沟通，明确双方的权利和义务，并尽量将协议内容书面化、具体化。
- 如果协议中有任何不明确或存在争议的地方，建议你及时咨询专业律师（比如我，李再庆律师，专注于建设工程、公司事务领域），以确保你的权益得到充分保障。
- 在你服役期间，也建议你保持与公司的联系，及时了解公司的动态和你的职位情况，以便在服役期满后能够顺利回归工作岗位。
总结来说，去当兵时与公司签订的协议是否有效，主要取决于协议内容是否合法、是否与法律法规相冲突以及双方的具体约定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。