若供应商违反废弃物处理协议，企业可采取以下法律措施进行应对：

1. 审查协议条款，明确违约情形
   首先需详细审查双方签订的废弃物处理协议，重点确认供应商的具体违约行为是否符合协议约定的违约条款（如未按时清运、处理方式不符合环保标准、未提供合规处理凭证等）。若协议中已明确约定违约金、赔偿标准或单方解约权，企业可直接依据协议主张权利。

2. 固定违约证据，确保举证充分
   需收集并保存供应商违约的客观证据，包括但不限于：

   • 废弃物未及时清运的现场照片、视频；
     
   • 环保部门出具的处罚决定书（如供应商因违规处理被行政处罚）；
     
   • 第三方检测机构出具的废弃物处理不符合标准的报告；
     
   • 双方沟通记录（邮件、微信、书面函件等）中供应商承认违约的表述。
     证据的充分性直接影响后续维权效果，建议委托律师协助梳理证据链。

3. 根据违约程度选择救济方式

   • 要求继续履行或补救：若违约行为可补救（如未按时清运但尚未造成环境污染），可书面要求供应商限期整改，并保留追究其逾期责任的权利。
     
   • 主张违约金或赔偿损失：若协议约定了违约金，可直接要求支付；若未约定或违约金不足以覆盖实际损失（如企业因供应商违约被环保部门处罚的罚款、额外委托第三方处理的费用等），可要求按实际损失赔偿。
     
   • 单方解除协议：若供应商的根本违约行为导致协议目的无法实现（如长期未处理废弃物导致企业生产停滞、因违规处理被吊销资质等），可依据《民法典》第五百六十三条行使法定解除权，并要求供应商承担违约责任。

4. 发送律师函或直接起诉

   • 律师函警告：在正式诉讼前，可委托律师向供应商发送《律师函》，明确其违约事实、法律后果及企业诉求，督促其限期履行义务或协商赔偿。律师函具有法律威慑力，可能推动双方快速和解。
     
   • 提起诉讼或仲裁：若供应商拒绝配合，可向法院提起民事诉讼（或依据协议约定申请仲裁），要求其承担违约责任。诉讼中需注意诉讼时效（一般为3年，自知道违约之日起计算）及管辖法院（协议有约定的从约定，无约定的由被告住所地或合同履行地法院管辖）。

5. 关注行政责任与刑事风险
   若供应商的违规处理行为涉嫌违反《固体废物污染环境防治法》等环保法规（如非法倾倒、伪造处理记录等），企业除主张民事赔偿外，还应及时向生态环境主管部门举报，由行政部门对其行政处罚（如罚款、吊销资质等）；若情节严重构成犯罪（如污染环境罪），可依法追究其刑事责任，同时企业作为委托方可能需承担连带责任，需提前评估风险并采取防范措施。

建议：废弃物处理协议中应明确约定违约责任条款（包括违约金标准、赔偿范围、解约条件等），并要求供应商提供担保（如保证金、履约保函等）以降低风险。若已发生违约，建议尽快委托律师介入，制定综合维权方案。