结论：事业单位人员经商被立案但未结案时，福利待遇是否扣减需分情况讨论，不能一概而论，具体取决于单位规章制度、地方政策以及案件性质等因素。以下展开详细分析：

1. 单位规章制度的影响

• 若单位规章制度明确规定“被立案调查期间暂停福利待遇”：
  部分事业单位会在内部规章中明确，员工因涉嫌违纪违法被立案调查期间，单位可暂停发放部分或全部福利待遇（如奖金、津贴、补贴等），但基本工资通常需保障生活需求，一般不会完全停发。
  法律依据：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第十六条，事业单位工作人员被依法判处刑罚的，给予降低岗位等级或者撤职以上处分；但“被立案”阶段尚未定性，单位需依据内部规定处理，且需保证程序合法（如经职工代表大会讨论通过）。

• 若单位规章制度未明确规定：
  单位无权单方面扣减福利待遇，否则可能构成违法。此时员工可要求单位说明扣减依据，或通过劳动仲裁维护权益。

2. 地方政策或行业规定的补充

• 部分地区或行业（如教育、医疗）可能出台专项规定，对“经商办企业”等违规行为设定更严格的处罚措施。例如，某些地方规定“被立案调查期间，暂停绩效工资发放”，但需以正式文件为依据。
  建议：员工可查询所在单位或主管部门的最新政策文件，或向当地人社部门咨询。

3. 案件性质与调查阶段的影响

• 若案件涉及严重违纪违法（如贪污、受贿）：
  单位可能依据《监察法》或《公职人员政务处分法》采取“停职检查”等措施，期间福利待遇可能受影响，但需以正式决定为准。
  
• 若案件仅涉及一般违规（如未报备经商）：
  单位通常需等待调查结论后再决定是否处罚，立案阶段一般不直接扣减福利。

4. 员工维权途径

• 与单位协商：要求单位出具书面扣减依据，并核对是否符合规章制度。
  
• 申请劳动仲裁：若单位无法提供合法依据，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张补发福利并赔偿损失。
  
• 投诉举报：向当地人社部门或纪检监察机关反映单位违规行为。

总结建议

1. 核实单位规章制度：优先查看单位内部文件，确认是否有“立案期间扣减福利”的条款。
   
2. 区分案件性质：若案件尚未定性，单位扣减福利需谨慎；若已定性为严重违规，则可能面临更严厉处罚。
   
3. 保留证据：保存工资条、扣减通知等材料，以便后续维权。
   

如有进一步疑问（如具体案件分析、规章制度解读），可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供更详细的建议。