结论：超过3年诉讼时效后，债务人只履行部分债务，并不直接导致对所有债权构成诉讼时效的中断。诉讼时效的中断需要满足法定条件，且通常针对的是特定债务或债权关系。以下从多个角度进行详细分析：
一、诉讼时效中断的法定条件
根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，诉讼时效的中断通常发生在以下情形之一：
- 权利人向义务人提出履行请求：这要求权利人明确表达要求义务人履行债务的意愿，且该请求需到达义务人。
- 义务人同意履行义务：这包括义务人明确表示愿意履行债务，或通过实际行动（如部分履行）表明其认可债务的存在。
- 权利人提起诉讼或者申请仲裁：这是通过法律途径主张权利，导致诉讼时效中断。
- 与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形：如权利人申请支付令、申请破产债权等。
二、债务人部分履行对诉讼时效的影响
部分履行不直接导致全部债权诉讼时效中断：
- 债务人部分履行债务，通常只被视为对该部分债务的认可，并不直接构成对全部债权诉讼时效的中断。因为诉讼时效是针对每一项独立债权或债务而设定的，部分履行并不自动扩展至其他未履行的部分。
可能构成对剩余债权诉讼时效中断的例外情况：
- 如果债务人部分履行的行为，结合其他证据（如书面协议、口头承诺等），能够证明债务人实际上认可了全部债务的存在，并愿意继续履行剩余债务，那么这种部分履行可能间接导致对剩余债权诉讼时效的中断。但这种情况需要具体证据支持，且并非自动发生。
三、实际操作中的建议
及时主张权利：
- 对于超过诉讼时效的债权，债权人应尽快与债务人沟通，要求债务人重新确认债务或签订还款协议，以中断诉讼时效并重新计算。
保留证据：
- 债权人应保留所有与债务相关的证据，包括借款合同、转账记录、聊天记录、部分履行的凭证等，以备在需要时证明债务的存在和债务人的认可。
咨询专业律师：
- 在处理涉及诉讼时效的债权问题时，债权人应咨询专业律师，了解具体法律条款和司法实践，以便制定合适的维权策略。
四、法律后果
- 如果债权人未能在诉讼时效期间内主张权利，且无法证明诉讼时效存在中断或中止的情形，那么债权人将丧失通过法律途径强制债务人履行债务的权利。债务人可以提出诉讼时效抗辩，拒绝履行债务。
总结：超过3年诉讼时效后，债务人只履行部分债务并不直接导致对所有债权构成诉讼时效的中断。债权人应了解诉讼时效的法定条件，及时主张权利，并保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。