当您的保健品店被别人投诉时，处理这一问题的关键在于积极应对、配合调查，并采取有效措施来改进和预防类似问题的再次发生。以下是一些详细且深入的步骤和建议，帮助您妥善处理此类情况：

一、了解投诉内容

首先，您需要明确投诉的具体内容，包括投诉人指出的违规行为、涉及的产品、时间地点等关键信息。这有助于您针对性地收集证据和准备回应。

二、收集证据和资料

1. 购买凭证和交易记录：整理所有与投诉相关的购买凭证、发票、收据或电子支付记录，以证明交易的合法性和真实性。
2. 产品资料：收集涉及投诉的保健品的包装、标签、说明书、宣传册等资料，特别是那些可能被投诉人误解或夸大宣传的部分。
3. 沟通记录：如果与投诉人有过沟通，保留好聊天记录、电话录音等，以证明您在销售过程中的态度和行为。
4. 其他证据：如店内监控录像、员工证言等，也可能对证明您的清白或解释情况有所帮助。

三、配合相关部门调查

1. 主动联系投诉人：在了解投诉内容后，您可以尝试主动联系投诉人，了解其具体诉求和不满，看是否能够通过协商解决问题。但请注意，在调查期间，避免与投诉人发生争执或冲突。
2. 配合市场监督管理部门调查：如果投诉已经转交至市场监督管理部门，您应积极配合其调查工作，提供所需的所有证据和资料。同时，保持与调查人员的良好沟通，及时解答其疑问。
3. 如有需要，寻求法律援助：如果投诉涉及复杂的法律问题或您对法律程序不熟悉，可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以确保您的权益得到妥善保护。

四、采取改进措施

1. 审查销售流程：对您的销售流程进行全面审查，确保所有环节都符合相关法律法规和行业标准。特别是要加强对产品宣传、推荐和销售行为的监管，避免夸大宣传或误导消费者。
2. 加强员工培训：对员工进行定期培训，提高其法律意识和职业道德水平。确保员工了解并遵守相关法律法规和公司政策，能够正确、客观地介绍产品。
3. 建立投诉处理机制：建立健全的投诉处理机制，确保能够及时、有效地处理消费者的投诉和反馈。对于消费者的合理诉求，应积极予以解决和补偿；对于不合理的投诉，也应耐心解释和沟通。

五、预防类似问题再次发生

1. 加强内部管理：完善内部管理制度，加强对产品采购、存储、销售等环节的监管。确保所有产品都符合相关法律法规和行业标准，避免销售不合格或违规产品。
2. 定期自查自纠：定期对店铺进行自查自纠，及时发现并纠正存在的问题和隐患。对于发现的问题，应立即采取措施进行整改，并防止类似问题再次发生。
3. 关注行业动态和政策变化：密切关注行业动态和政策变化，及时调整经营策略和销售行为。确保您的店铺始终符合相关法律法规和行业标准的要求。

六、保持与消费者的良好沟通

在处理投诉的过程中和之后，都应保持与消费者的良好沟通。通过积极、诚恳的态度和行动，赢得消费者的信任和理解。这有助于提升您的店铺形象和声誉，促进业务的长期发展。

总之，当您的保健品店被别人投诉时，不要慌张或逃避。而是应积极应对、配合调查、采取改进措施并预防类似问题再次发生。通过这些努力，您不仅能够妥善处理当前的投诉问题，还能够提升店铺的管理水平和市场竞争力。