债务人厂房被查封后，一般不能直接申请以物抵债，但满足一定条件时可以申请。具体分析如下：

1. 查封阶段通常不允许直接以物抵债
   根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》，查封是执行程序中的控制性措施，目的是防止财产转移或贬值，保障后续拍卖、变卖等处置程序的顺利进行。在查封阶段，法院尚未对财产价值进行评估，也未启动拍卖程序，因此债务人或债权人通常不能直接申请以物抵债。

2. 满足特定条件时可申请以物抵债
   若查封后进入执行程序，且符合以下条件，债务人或债权人可申请以物抵债：

   • 双方协商一致：债务人与债权人达成书面协议，同意以查封的厂房抵偿债务，且不损害其他债权人利益；
     
   • 法院组织拍卖流拍：若厂房经两次拍卖仍无人竞买，或债权人拒绝接受以拍卖保留价抵债，法院可依申请或依职权裁定以物抵债；
     
   • 财产无法拍卖或变卖：如厂房因特殊原因（如产权纠纷、规划限制）无法拍卖或变卖，法院可酌情裁定以物抵债。

3. 以物抵债的法定程序
   即使满足条件，以物抵债也需经法院审查并出具裁定书，而非债务人单方申请即可生效。裁定书会明确抵债金额、财产交付方式等关键条款，确保程序合法性。

建议：若您是债务人，可主动与债权人协商以物抵债方案，并申请法院介入审查；若您是债权人，需关注拍卖进展，及时在流拍后提出抵债申请。具体操作需结合厂房权属、债务金额等细节，如有疑问可进一步向我咨询。